# Calculadora de massa molecular de proteína (por sequência)

Calcula a massa molecular de uma proteína a partir da sequência: MW = Σ massas médias dos resíduos + H₂O (18,01524 Da), com a mesma tabela do ExPASy ProtParam (A 71,0788 … W 186,2132). A entrada não diferencia maiúsculas; espaços e separadores * - . são removidos; códigos de ambiguidade (B/J/O/U/X/Z) não são somados, mas contados e reportados. O resultado é a cadeia polipeptídica não modificada: sem remoção de peptídeo sinal, pontes dissulfeto (−2H por ponte), PTMs ou tags. Retorna kDa, massa média por resíduo e comprimento. Fontes: ExPASy ProtParam (Gasteiger 2005), manual de Fasman. Apenas para educação.

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- **Categoria:** Education

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## Visão geral

Calcule a massa molecular média de uma proteína a partir da sequência de aminoácidos. A ferramenta soma as massas médias dos resíduos, adiciona H₂O e retorna o valor em Da, kDa, a massa média por resíduo e o comprimento da cadeia.

## Entradas

- **Sequência de aminoácidos** (textarea): One-letter amino-acid sequence (case-insensitive; spaces and * - . separators are ignored).
- **Casas decimais** (number)

## Quando usar

- Estimar a massa molecular de uma proteína ou peptídeo a partir da sequência.
- Converter uma sequência de aminoácidos em massa aproximada em Da e kDa.
- Conferir sequências padrão ou tags de afinidade antes de planejar um experimento.

## Como funciona

- Insira a sequência de aminoácidos usando o código de uma letra, sem distinguir maiúsculas de minúsculas.
- A ferramenta remove espaços e os separadores * - . da entrada.
- As massas médias dos resíduos são somadas e a massa de H₂O, 18,01524 Da, é adicionada.
- O resultado informa massa em Da e kDa, comprimento, massa média por resíduo e eventuais códigos ambíguos.

## Casos de uso

- Estimativa rápida da massa de proteínas recombinantes e peptídeos.
- Verificação de tags de afinidade e sequências usadas em construções de expressão.
- Conferência educacional de tabelas de massas médias de aminoácidos.

## Perguntas frequentes

### Quais símbolos podem ser usados na sequência?

Use os códigos de uma letra dos aminoácidos. Espaços e os separadores * - . são ignorados.

### A sequência diferencia letras maiúsculas e minúsculas?

Não. A entrada não diferencia maiúsculas de minúsculas.

### Como a massa molecular é calculada?

A ferramenta soma as massas médias dos resíduos e adiciona 18,01524 Da, correspondente à água.

### Como os códigos B, J, O, U, X e Z são tratados?

Eles não são incluídos na soma da massa, mas são contados e reportados no resultado.

### O resultado inclui modificações ou remoção de peptídeo sinal?

Não. O cálculo representa a cadeia polipeptídica não modificada, sem PTMs, tags, remoção de peptídeo sinal ou ajuste por pontes dissulfeto.

## Ferramentas relacionadas

- [Analisador de composição de aminoácidos](https://elysiatools.com/pt/tools/amino-acid-composition): Analisa a composição de uma sequência: contagens e percentagens molares de cada um dos 20 aminoácidos padrão; totais por grupo (básicos K/R/H, ácidos D/E, aromáticos F/W/Y, sulfurados C/M, alifáticos A/I/L/V, amidas N/Q, hidroxila S/T, outros G/P); GRAVY com os valores de hidropatia de Kyte–Doolittle 1982 (>0 tendência hidrofóbica, <0 hidrofílica; globulares solúveis ficam entre −1 e +0,3); e a massa molecular pela tabela ProtParam. Códigos de ambiguidade (B/J/O/U/X/Z) contam-se à parte e excluem-se das percentagens. Fontes: Kyte & Doolittle 1982, ExPASy ProtParam, Lehninger. Apenas para educação.
- [Simulador do efeito gargalo genético (perda de heterozigosidade)](https://elysiatools.com/pt/tools/bottleneck-effect-simulator): Simula a perda esperada de heterozigosidade após um gargalo (esperança determinística). Sob deriva Wright-Fisher ideal, H_{t+1} = H_t(1 − 1/(2N)) por geração, logo H_final = H₀(1−1/2Nb)^t × (1−1/2Nr)^g; o tamanho efetivo harmônico Ne = (t+g)/(t/Nb + g/Nr) é dominado pelo mínimo; F acumulado = 1 − H_final/H₀. Para um alelo de frequência p, a sobrevivência a UMA geração de gargalo é 1 − (1−p)^(2Nb); alelos raros perdem-se primeiro. Casos clássicos: elefante-marinho-do-norte (~20 sobreviventes em 1890), guepardo, nēnē do Havaí, bisão-europeu, atol Pingelap. Fontes: Wright 1931, Nei et al. 1975, Hartl & Clark 2007, StatPearls. Apenas uso educativo.
- [Calculadora de comprimento de fragmentos de restrição](https://elysiatools.com/pt/tools/restriction-fragment-length): Estima os tamanhos dos fragmentos após a digestão: um substrato circular com n cortes produz n fragmentos (contornando a origem) e um linear produz n+1. O modo de posições calcula fragmentos exatos a partir de coordenadas separadas por vírgula; o modo de número de sítios dá a contagem e a média com distribuição uniforme. Inclui a frequência esperada de sítios em DNA aleatório: enzimas de 4 bases ~1 a cada 256 bp, de 6 bases ~1 a cada 4096 bp (REBASE/Sambrook) e avisos de resolução em agarose (<50 bp pode escapar). Fontes: Sambrook & Russell 3ª ed., REBASE. Apenas para educação.
- [Calculadora de eficiência de transfecção (taxa GFP+)](https://elysiatools.com/pt/tools/transfection-efficiency): Calcula a eficiência de transfecção pela taxa GFP+: eficiência = células GFP+ ÷ total × 100. O modo de medição única acrescenta intervalo de confiança Wilson de 95% (mais confiável que a aproximação normal em contagens pequenas); o modo de réplicas recebe contagens paralelas separadas por vírgula e devolve eficiência por poço, média e desvio padrão amostral (n−1). Faixas de interpretação: ≥70% excelente (linhas fáceis HEK293/CHO), 30–70% bom, 10–30% moderado, <10% baixo (considerar eletroporação ou vetores virais). Premissas: mesmo limiar de GFP, excluir células mortas, leitura no pico de 24–72 h. Fontes: Wilson 1927, Newcombe 1998, Kim & Eberwine 2010. Apenas para educação.
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- [Estimador de Confluência Celular (método de grade)](https://elysiatools.com/pt/tools/confluency-estimator): Estima a confluência de células aderentes pelo método de grade em microscopia: confluência% = quadrados ocupados ÷ quadrados totais × 100 por campo. Aceita vários campos e calcula média ± desvio padrão, amplitude e interpretação do crescimento (<10% esparsa, 10–50% subconfluente, 50–80% aproximando, 80–95% quase confluyente, ≥95% confluente). Com o tempo de duplicação, estima as horas até a confluência alvo: t = TD × log₂(alvo/atual). Conte 3–5 campos aleatórios; passe a 70–90%.
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## Exemplos

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