# Simulador do efeito gargalo genético (perda de heterozigosidade) Simula a perda esperada de heterozigosidade após um gargalo (esperança determinística). Sob deriva Wright-Fisher ideal, H_{t+1} = H_t(1 − 1/(2N)) por geração, logo H_final = H₀(1−1/2Nb)^t × (1−1/2Nr)^g; o tamanho efetivo harmônico Ne = (t+g)/(t/Nb + g/Nr) é dominado pelo mínimo; F acumulado = 1 − H_final/H₀. Para um alelo de frequência p, a sobrevivência a UMA geração de gargalo é 1 − (1−p)^(2Nb); alelos raros perdem-se primeiro. Casos clássicos: elefante-marinho-do-norte (~20 sobreviventes em 1890), guepardo, nēnē do Havaí, bisão-europeu, atol Pingelap. Fontes: Wright 1931, Nei et al. 1975, Hartl & Clark 2007, StatPearls. Apenas uso educativo. > Página canônica: https://elysiatools.com/pt/tools/bottleneck-effect-simulator - **Categoria:** Education - **Palavras-chave:** efeito gargalo, gargalo populacional, deriva genética, perda de heterozigosidade, tamanho efetivo, endogamia, diversidade genética, genética da conservação, genética de populações, genética ## Visão geral O Simulador do efeito gargalo genético estima a perda esperada de heterozigosidade após um período de redução populacional e uma possível recuperação. Informe a heterozigosidade inicial, os tamanhos populacionais, o número de gerações e a frequência de um alelo focal para obter H final, retenção, coeficiente de endogamia, tamanho efetivo harmônico e sobrevivência do alelo em uma geração de gargalo. Uso exclusivamente educativo. ## Entradas - **Heterozigosidade inicial H₀** (number): Heterozygosity before the bottleneck (0 < H₀ ≤ 1). - **Tamanho da população no gargalo** (number): Census size during the bottleneck (Nb). - **Gerações no gargalo** (number): Number of generations spent at the bottleneck size (t). - **Tamanho da população em recuperação** (number): Census size after recovery (Nr). - **Gerações de recuperação** (number): Generations spent at the recovery size (g; 0 to skip). - **Frequência do alelo focal** (number): Frequency p of a focal allele used for the one-generation bottleneck survival estimate. - **Casas decimais** (number) ## Quando usar - Estimar como um gargalo populacional pode reduzir a heterozigosidade ao longo de várias gerações. - Comparar cenários de gargalo moderado ou severo com diferentes tamanhos e durações. - Avaliar a sobrevivência, em uma geração, de um alelo com determinada frequência inicial. ## Como funciona - Informe H₀, a heterozigosidade antes do gargalo, além de Nb, t, Nr e g para representar o tamanho e a duração de cada fase. - O simulador aplica H_final = H₀(1 − 1/(2Nb))^t × (1 − 1/(2Nr))^g sob o modelo ideal de deriva Wright-Fisher. - A saída apresenta a heterozigosidade final, a porcentagem retida, F = 1 − H_final/H₀ e o tamanho efetivo harmônico Ne. - A frequência do alelo focal é usada para calcular sua sobrevivência em uma única geração de gargalo: 1 − (1 − p)^(2Nb). ## Casos de uso - Aulas de genética de populações sobre deriva genética, endogamia e diversidade genética. - Análises introdutórias de conservação para ilustrar os efeitos de reduções populacionais intensas. - Comparações didáticas entre populações que se recuperam rapidamente e populações submetidas a gargalos prolongados. ## Perguntas frequentes ### O que é a heterozigosidade inicial H₀? É a heterozigosidade da população antes do gargalo. Deve ser um valor maior que 0 e até 1. ### O que representam Nb e Nr? Nb é o tamanho populacional durante o gargalo; Nr é o tamanho populacional durante a recuperação. ### Como a duração do gargalo afeta o resultado? Quanto maior o número de gerações no gargalo, maior tende a ser a perda esperada de heterozigosidade. ### O que significa o coeficiente F? F representa a fração acumulada de heterozigosidade perdida em relação ao valor inicial. ### O simulador representa uma população real? Não. Ele calcula uma expectativa determinística baseada no modelo ideal de Wright-Fisher e tem finalidade educativa. ## Ferramentas relacionadas - [Analisador de composição de aminoácidos](https://elysiatools.com/pt/tools/amino-acid-composition): Analisa a composição de uma sequência: contagens e percentagens molares de cada um dos 20 aminoácidos padrão; totais por grupo (básicos K/R/H, ácidos D/E, aromáticos F/W/Y, sulfurados C/M, alifáticos A/I/L/V, amidas N/Q, hidroxila S/T, outros G/P); GRAVY com os valores de hidropatia de Kyte–Doolittle 1982 (>0 tendência hidrofóbica, <0 hidrofílica; globulares solúveis ficam entre −1 e +0,3); e a massa molecular pela tabela ProtParam. Códigos de ambiguidade (B/J/O/U/X/Z) contam-se à parte e excluem-se das percentagens. Fontes: Kyte & Doolittle 1982, ExPASy ProtParam, Lehninger. Apenas para educação. - [Calculadora de massa molecular de proteína (por sequência)](https://elysiatools.com/pt/tools/protein-molecular-weight): Calcula a massa molecular de uma proteína a partir da sequência: MW = Σ massas médias dos resíduos + H₂O (18,01524 Da), com a mesma tabela do ExPASy ProtParam (A 71,0788 … W 186,2132). A entrada não diferencia maiúsculas; espaços e separadores * - . são removidos; códigos de ambiguidade (B/J/O/U/X/Z) não são somados, mas contados e reportados. O resultado é a cadeia polipeptídica não modificada: sem remoção de peptídeo sinal, pontes dissulfeto (−2H por ponte), PTMs ou tags. Retorna kDa, massa média por resíduo e comprimento. Fontes: ExPASy ProtParam (Gasteiger 2005), manual de Fasman. Apenas para educação. - [Calculadora de comprimento de fragmentos de restrição](https://elysiatools.com/pt/tools/restriction-fragment-length): Estima os tamanhos dos fragmentos após a digestão: um substrato circular com n cortes produz n fragmentos (contornando a origem) e um linear produz n+1. O modo de posições calcula fragmentos exatos a partir de coordenadas separadas por vírgula; o modo de número de sítios dá a contagem e a média com distribuição uniforme. Inclui a frequência esperada de sítios em DNA aleatório: enzimas de 4 bases ~1 a cada 256 bp, de 6 bases ~1 a cada 4096 bp (REBASE/Sambrook) e avisos de resolução em agarose (<50 bp pode escapar). Fontes: Sambrook & Russell 3ª ed., REBASE. Apenas para educação. - [Calculadora de eficiência de transfecção (taxa GFP+)](https://elysiatools.com/pt/tools/transfection-efficiency): Calcula a eficiência de transfecção pela taxa GFP+: eficiência = células GFP+ ÷ total × 100. O modo de medição única acrescenta intervalo de confiança Wilson de 95% (mais confiável que a aproximação normal em contagens pequenas); o modo de réplicas recebe contagens paralelas separadas por vírgula e devolve eficiência por poço, média e desvio padrão amostral (n−1). Faixas de interpretação: ≥70% excelente (linhas fáceis HEK293/CHO), 30–70% bom, 10–30% moderado, <10% baixo (considerar eletroporação ou vetores virais). Premissas: mesmo limiar de GFP, excluir células mortas, leitura no pico de 24–72 h. Fontes: Wilson 1927, Newcombe 1998, Kim & Eberwine 2010. Apenas para educação. - [Tutor de autômatos finitos, Mealy/Moore, Karnaugh e minimização](https://elysiatools.com/pt/tools/finite-state-machine-mealy-moore-karnaugh-minimization-tutor): Explica passo a passo autômatos e lógica combinacional: construção por subconjuntos ε-NFA→NFA→DFA, minimização por refinamento de partições de Moore, conversão Mealy↔Moore; agrupamento Gray em Karnaugh e Quine-McCluskey com implicantes primos e cobertura mínima exata para o SOP mínimo. Inclui diagramas ASCII, tabelas e iterações. - [Gerador de baralho SRS a partir de lista de frequência](https://elysiatools.com/pt/tools/language-vocab-spaced-repetition-deck-generator): Cole uma lista de vocabulário bilíngue e exporte um baralho compatível com Anki que divide cada entrada em cartões de reconhecimento, recordação e cloze com classe, IPA e frases de exemplo, além de prévia SM-2. - [Conversor de Velocidade Angular (rad/s / rpm / deg/s / Hz)](https://elysiatools.com/pt/tools/angular-velocity-converter): Conversão de velocidade angular: rad/s (base SI) ↔ rpm (1=2π/60 rad/s) ↔ grau/s (1=π/180 rad/s) ↔ Hz (1 rotação/s=2π rad/s). Hz aqui = rotação por segundo. Conversão via rad/s com os quatro equivalentes. Ref.: vinil 33⅓ rpm≈3,49 rad/s, marcha lenta ~800 rpm≈83,8 rad/s. - [Taxa Metabólica Basal Estendida (comparação de fórmulas)](https://elysiatools.com/pt/tools/basal-metabolic-rate-ext): Calcula em paralelo as cinco equações clássicas do metabolismo basal adulto com média e amplitude: Mifflin-St Jeor (padrão atual da ADA), Harris-Benedict original (1919, costuma superestimar ~5%), Harris-Benedict revisado (Roza & Shizgal 1984), Schofield (FAO/OMS/ONU 1985, por faixas de idade; superestima em climas tropicais e obesidade) e Katch-McArdle (massa magra opcional: 370 + 21,6×MM). Resultados em kcal/dia com notas sobre a origem das diferenças. Complementa o bmr-calculator de fórmula única e a ferramenta tdee só-Mifflin. Fontes: Mifflin 1990, Roza 1984, FAO/OMS/ONU 1985, ADA. Adultos saudáveis 18–100 anos. Não é conselho médico. ## Exemplos - [Exemplos de Processamento de Imagem Web Python](https://elysiatools.com/pt/samples/web-image-processing-python): Exemplos de processamento de imagem Web Python usando PIL/Pillow incluindo leitura, salvamento, redimensionamento e conversão de formato - [Exemplos de Processamento de Imagem Android Java](https://elysiatools.com/pt/samples/android-image-processing-java): Exemplos de processamento de imagem Android Java incluindo leitura/escrita, dimensionamento e conversão de formato - [Exemplos de Processamento de Imagem Android Kotlin](https://elysiatools.com/pt/samples/android-image-processing-kotlin): Exemplos de processamento de imagem Android Kotlin incluindo leitura/escrita, dimensionamento e conversão de formato - [Exemplos de Processamento de Imagem Web Rust](https://elysiatools.com/pt/samples/web-image-processing-rust): Exemplos de processamento de imagem Web Rust incluindo leitura/gravação, redimensionamento e conversão de formato ## Conteúdo relacionado - [Ferramentas de codigo de barras, QR e etiquetas](https://elysiatools.com/pt/hubs/barcode-utility): Reune em um so hub ferramentas para gerar codigos de barras, criar e decodificar QR, validar UPC/EAN, compartilhar WiFi por QR e preparar etiquetas imprimiveis. - [Ferramentas de codificacao e conversao de audio](https://elysiatools.com/pt/hubs/audio-convert): Compare conversao de formatos de audio, ajustes de bitrate, conversao de taxa de amostragem, troca de codec e exportacao em um unico hub. - [Ferramentas de conversao de formatos de imagem e exportacao animada](https://elysiatools.com/pt/hubs/image-convert): Compare conversores de imagem para JPG, PNG, GIF, AVIF, WebP, TIFF, ICO, base64 e saidas voltadas para animacao em um unico hub. - [Ferramentas de intercambio JSON e traducao de formatos](https://elysiatools.com/pt/hubs/json-convert): Compare ferramentas de conversao JSON para CSV, YAML, TOML, GraphQL, XML, Markdown, Excel, BSON, EDN e outros formatos estruturados em um unico hub.