# Indice de Diversité de Shannon (H′)

Calcule l'indice de Shannon (Shannon–Wiener) : H′ = −Σpᵢ·ln pᵢ, avec pᵢ = nᵢ/N. H′ augmente avec la richesse S et avec l'équitabilité ; bases ln (convention classique), log₂ (bits par espèce) ou log₁₀. Indique H′max = ln(S) et l'équitabilité de Pielou J = H′/ln(S) (0–1 ; J=1 parfaitement uniforme). Repères : H′ < 1 faible, 1–3 modéré–élevé, > 3 très élevé (contextuel ; comparez des communautés à S proche).

> Page canonique: https://elysiatools.com/fr/tools/shannon-diversity-index

- **Catégorie:** Health

- **Mots-clés:** indice de shannon, shannon wiener, diversité des espèces, équitabilité de pielou, richesse spécifique, calculateur d'écologie, biodiversité, structure de communauté, entropie, équitabilité, calculateur de laboratoire, écologie

## Présentation

Calculez l'indice de Shannon–Wiener H′ = −Σpᵢ·ln pᵢ à partir des effectifs par espèce (pᵢ = nᵢ/N). L'outil renvoie aussi H′max = ln(S) et l'équitabilité de Pielou J = H′/ln(S). Choisissez la base ln (classique), log₂ ou log₁₀.

## Entrées

- **Effectifs par espèce (un par ligne)** (textarea): One abundance count per species, separated by new lines, commas, or spaces.
- **Base du logarithme** (select)

## Quand l'utiliser

- Comparer la diversité de communautés à richesse S proche en écologie de terrain ou en laboratoire.
- Obtenir H′, H′max et J à partir d'une liste d'abondances pour un rapport ou un protocole.
- Vérifier l'effet de la base du logarithme (ln, bits par espèce ou log₁₀) sur le même jeu de comptages.

## Fonctionnement

- Saisissez un effectif par espèce, un par ligne, ou séparés par des virgules ou des espaces.
- Choisissez la base : ln (convention écologique), log₂ (bits par espèce) ou log₁₀.
- Le calcul détermine S, N, les proportions pᵢ, puis H′ = −Σ pᵢ log pᵢ, H′max et J.
- Le résultat JSON indique H′, l'interprétation d'équitabilité et les métadonnées (richesse, N, proportions).

## Cas d'usage

- Inventaire de terrain : calculer H′ et J d'un relevé d'abondances pour un mémoire ou un article.
- Cours d'écologie : illustrer comment la richesse S plafonne H′ même si J est élevé.
- Suivi de laboratoire : comparer deux échantillons (même base) pour détecter une perte d'équitabilité.

## Questions fréquentes

### Quelle formule est utilisée ?

H′ = −Σ pᵢ · log pᵢ avec pᵢ = nᵢ/N. La base du logarithme est celle que vous sélectionnez (ln par défaut).

### Que signifient H′max et J ?

H′max = log(S) est la diversité maximale pour S espèces. J = H′/H′max (0–1) mesure l'équitabilité de Pielou ; J = 1 si les abondances sont parfaitement égales.

### Comment interpréter la valeur de H′ ?

Repères usuels (contextuels) : H′ < 1 faible, 1–3 modéré à élevé, > 3 très élevé. Comparez surtout des communautés de richesse S similaire.

### Quels formats d'effectifs sont acceptés ?

Un nombre entier ou décimal par espèce, séparés par des retours à la ligne, des virgules ou des espaces. Chaque valeur est un effectif nᵢ.

### La base change-t-elle le classement des communautés ?

Non : ln, log₂ et log₁₀ ne font que redimensionner H′ et H′max. L'équitabilité J reste identique car le rapport est invariant.

## Outils associés

- [Calculateur du Gradient Alvéolo-Artériel en Oxygène (A-a)](https://elysiatools.com/fr/tools/a-a-gradient-calculator): Calcule le gradient alvéolo-artériel en O₂ (A-a) pour distinguer les causes d'hypoxémie. Équation alvéolaire : PAO₂ = FiO₂ × (P_atm − 47) − PaCO₂ / 0.8 (QR défaut 0.8) ; A-a = PAO₂ − PaO₂. Normal ≈ (âge + 10) / 4 (air ambiant, jeune <15 mmHg, +3 mmHg par décennie). A-a normal : hypoventilation ou altitude (PaCO₂ élevé) ; élevé : déséquilibre V/Q, shunt, trouble de diffusion ou faible O₂ veineux. P_atm défaut 760. Sources : StatPearls NBK545153, LITFL, Cornell PICU. Non un avis médical.
- [Équation des Gaz Alvéolaires (Calculateur de PAO₂)](https://elysiatools.com/fr/tools/alveolar-gas-equation): Calcule la pression alvéolaire en oxygène PAO₂ = FiO₂ × (P_atm − 47) − PaCO₂ / RQ. P_atm par défaut 760 mmHg (niveau de la mer), ajustable selon l'altitude ; P_H₂O = 47 mmHg ; RQ par défaut 0.8 (diète mixte). Se concentre sur le PAO₂ avec une indication directionnelle par rapport à la valeur attendue ~100 mmHg au niveau de la mer. Pour l'interprétation complète du gradient A-a, voir a-a-gradient-calculator. Sources : StatPearls NBK545153, LITFL, Cornell PICU, West. Non un avis médical.
- [Calculateur de Ventilation Alvéolaire (VA = (VT − VD) × RR)](https://elysiatools.com/fr/tools/alveolar-ventilation-calculator): Calcule la ventilation alvéolaire par minute VA = (VT − VD) × RR, en convertissant mL/min en L/min. VT et RR sont obligatoires ; l'espace mort VD peut être fourni ou estimé à ~2 mL/kg de poids idéal (approximation de Radford). Adulte normal au repos ~4–6 L/min ; bas → hypercapnie (insuffisance respiratoire type II) ; élevé → hypocapnie (alcalose respiratoire). Sources : West, LITFL, StatPearls, Radford 1955. Non un avis médical.
- [Score d'Apgar (1 et 5 minutes)](https://elysiatools.com/fr/tools/apgar-score): Évalue l'état du nouveau-né (1 et 5 minutes ; si le score à 5 min est bas, répéter à 10 min) : coloration (pâle/bleu partout=0, extrémités bleues/corps rose=1, tout rose=2), pouls (absent=0, <100=1, ≥100 bpm=2), réflexe (aucune réponse=0, grimace=1, toux/éternuement/cri vigoureux=2), tonus (flasque=0, une certaine flexion=1, mouvements actifs=2), respiration (absente=0, lente/irrégulière/cri faible=1, cri bon et vigoureux=2) ; chaque item 0-2, total 0-10 par instant. 7-10 rassurant ; 4-6 modérément anormal (peut nécessiter une assistance) ; 0-3 critique (réanimation immédiate). Le score à 5 min et son évolution par rapport à 1 min reflètent la réponse à la réanimation. Sources : Apgar 1953, ACOG 2006, AAP/ACOG. C'est un instantané physiologique, ne marque pas à lui seul l'asphyxie ou une atteinte neurologique. Non un avis médical.
- [Conversion OD600 → CFU/mL (pente de calibration)](https://elysiatools.com/fr/tools/bacterial-growth-od): Convertit l'OD600 en concentration viable via la pente de calibration : CFU/mL = (OD600 − blanc) × facteur × dilution. Le facteur représente les CFU/mL à OD600 = 1 et dépend fortement de la souche, du milieu et du spectrophotomètre ; les préréglages ne sont que des ordres de grandeur : E. coli ≈ 1×10⁹, B. subtilis ≈ 5×10⁸, S. cerevisiae ≈ 1×10⁷. Calibrez par dénombrement sur plaque. La linéarité va jusqu'à ~0.2–0.6 ; au-delà d'un OD net de 0.6, l'outil conseille de diluer. Volume optionnel pour le CFU total.
- [Équation de Henderson-Hasselbalch (pH/HCO₃⁻/PCO₂)](https://elysiatools.com/fr/tools/bicarbonate-ph-conversion): Résout la troisième des trois variables pH, HCO₃⁻, PaCO₂ par l'équation de Henderson-Hasselbalch à partir de deux : pH = 6.1 + log10(HCO₃⁻/(0.03×PaCO₂)) ; HCO₃⁻ = 0.03×PaCO₂×10^(pH−6.1) ; PaCO₂ = HCO₃⁻/(0.03×10^(pH−6.1)). Rapporte aussi la forme linéaire de Henderson : \[H⁺\] = 24×PaCO₂/HCO₃⁻ et le pH correspondant. Règle : à chaque baisse de 0.1 du pH, \[H⁺\] augmente de ~10 nmol/L. Outil ciblé sur l'équation ; pour l'interprétation complète voir blood-gas-anion-gap. Sources : Henderson 1908, Hasselbalch 1916, Siggaard-Andersen 1974, LITFL, StatPearls, Berend 2016. Non un avis médical.
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## Exemples

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