# Calculateur de fréquence de recombinaison et carte génétique (cM)

Convertit entre fréquence de recombinaison et distance de carte génétique. r = recombinants / descendance totale (r ≤ 0.5 ; tend vers 0.5 pour gènes distants ou sur des chromosomes différents). Trois fonctions de cartographie (d en morgans, 1 M = 100 cM) : linéaire d = r (courtes distances seulement) ; Haldane 1919 : d = −½ln(1−2r) (sans interférence) ; Kosambi 1944 : d = ¼ln((1+2r)/(1−2r)) (interférence positive). Elles corrigent la sous-estimation par les doubles crossing-over : pour un même r, Haldane ≥ Kosambi ≥ linéaire. Le mode intervalles somme les distances et prédit r par les fonctions inverses (la carte totale peut dépasser 50 cM tandis que r sature à 50%). Sources : Sturtevant 1913, Haldane 1919, Kosambi 1944, Griffiths. Usage éducatif uniquement.

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- **Catégorie:** Education

- **Mots-clés:** fréquence de recombinaison, distance de carte génétique, centimorgan, fonction de cartographie, fonction de Haldane, fonction de Kosambi, double crossing-over, carte de liaison, cartographie génique, génétique

## Présentation

Ce calculateur convertit des comptages de descendants en fréquence de recombinaison et en distance génétique, ou additionne des intervalles en centimorgans pour prédire la recombinaison selon les fonctions linéaire, de Haldane et de Kosambi.

## Entrées

- **Mode de calcul** (select): From recombination counts, or from a list of map intervals.
- **Recombinants** (number): Recombinant offspring in a testcross (counts mode).
- **Descendance totale** (number): Total offspring scored (counts mode).
- **Distances d'intervalle en cM** (text): Comma-separated adjacent interval distances in centimorgans (intervals mode).
- **Décimales** (number)

## Quand l'utiliser

- Après un croisement test, pour calculer r à partir du nombre de recombinants et de la descendance totale.
- Pour comparer les distances obtenues avec l’approximation linéaire et les fonctions de Haldane et de Kosambi.
- Pour additionner plusieurs intervalles adjacents et estimer la fréquence de recombinaison sur toute la région.

## Fonctionnement

- Choisissez le mode « Comptages » ou « Intervalles ».
- Saisissez les recombinants et la descendance totale, ou une liste de distances en cM séparées par des virgules.
- Définissez le nombre de décimales souhaité, de 0 à 8.
- Consultez le résultat JSON contenant la fréquence, les distances calculées ou la distance totale et les valeurs de r prédites.

## Cas d'usage

- Vérifier les calculs d’un exercice de cartographie génétique.
- Interpréter les résultats d’un croisement test en comparant trois fonctions de cartographie.
- Estimer la recombinaison entre les extrémités d’une série d’intervalles génétiques.

## Questions fréquentes

### Comment la fréquence de recombinaison est-elle calculée ?

Elle correspond au nombre de descendants recombinants divisé par la descendance totale : r = recombinants / total.

### Quelle est la différence entre les modèles linéaire, Haldane et Kosambi ?

Le modèle linéaire convient surtout aux courtes distances. Haldane suppose l’absence d’interférence, tandis que Kosambi tient compte d’une interférence positive.

### Pourquoi les distances calculées diffèrent-elles pour un même r ?

Haldane et Kosambi corrigent la sous-estimation due aux doubles crossing-over non détectés ; pour un même r, Haldane ≥ Kosambi ≥ linéaire.

### Une distance génétique peut-elle dépasser 50 cM ?

Oui. Une carte peut dépasser 50 cM, même si la fréquence de recombinaison observable tend vers 50 %.

### Comment saisir plusieurs intervalles ?

Entrez les distances adjacentes en cM, séparées par des virgules, par exemple 5.2, 8.1, 12.0.

## Outils associés

- [Convertisseur Absorbance↔Transmittance (A = −log₁₀T)](https://elysiatools.com/fr/tools/absorbance-transmittance-converter): Convertit dans les deux sens absorbance et transmittance : A = −log₁₀(T), T = 10⁻ᴬ, %T = 100·T et A = 2 − log₁₀(%T). Accepte l'absorbance A, la transmittance en pourcentage %T ou en fraction T et renvoie les trois représentations à la fois. Repères : A=0 → %T=100 ; A=1 → %T=10 ; A=0,301 → %T=50. Une absorbance négative impliquerait %T > 100 %, impossible en spectrophotométrie standard, et est rejetée.
- [Calculateur de température d'hybridation PCR (Ta = Tm − 5°C)](https://elysiatools.com/fr/tools/annealing-temperature-calculator): Calcule la température d'hybridation (Ta) de la PCR selon deux règles : la règle simple de paillasse Ta = Tm − 5°C (en prenant le PLUS PETIT Tm de la paire d'amorces) et la formule empirique de Rychlik 1990 : Ta = 0.3×Tm(amorce) + 0.7×Tm(produit) − 14.9 (le Tm du produit est typiquement de 75–90°C et la formule tombe 1–8°C au-dessus de la règle simple pour des paires classiques). Fournit la Ta recommandée, une plage de gradient ±3°C et le sens d'ajustement : Ta trop basse donne bandes non spécifiques et dimères, trop haute aucun produit ; gardez les deux Tm à 2–3°C près et hybridez sur le plus petit. Sources : Rychlik 1990, Innis & Gelfand 1990, Lorenz 2012. Uniquement pour la planification.
- [Analyseur de pedigree d'hérédité autosomique dominante](https://elysiatools.com/fr/tools/autosomal-dominant-pedigree): Calcule le risque pour la descendance dans l'hérédité autosomique dominante (AD) et évalue l'ajustement des effectifs observés au ratio attendu. Génotypes parentaux → ratio attendu : AA × n'importe = tous atteints ; Aa × Aa = 3:1 (75%) ; Aa × aa = 1:1 (50%) ; aa × aa = aucun. Les effectifs observés permettent un test du chi-carré (df = 1, critique 3.841). Signes du pedigree AD : transmission verticale, deux sexes atteints à parts égales, transmission homme-homme présente (exclut le dominant lié à l'X), les non-atteints ne transmettent pas (sauf mutation de novo). Exemples : Huntington, achondroplasie, Marfan. Sources : Griffiths, Hartl & Clark 2007, StatPearls, OMIM. Usage éducatif uniquement.
- [Calculateur de risque d'hérédité autosomique récessive](https://elysiatools.com/fr/tools/autosomal-recessive-risk): Calcule la probabilité qu'un enfant (ou qu'au moins un de n enfants) soit atteint d'une maladie autosomique récessive. Un enfant atteint (aa) doit recevoir un allèle récessif de CHACUN des parents : P(enfant atteint) = P(parent 1 transmet a) × P(parent 2 transmet a). Statuts : porteur (Aa), atteint (aa), non porteur (AA), inconnu (P(Aa)=c, P(aa)=c² selon la fréquence populationnelle). Deux porteurs → 25% par enfant, 50% porteurs, P(porteur | non atteint) = 2/3 ; au moins un atteint parmi n = 1 − (1−r)^n. Défaut 0.04 (mucoviscidose 1/25). Sources : Griffiths, Hartl & Clark 2007, StatPearls. Usage éducatif uniquement, ne remplace pas un conseil génétique.
- [Calculateur de numération cellulaire à l'hémocytomètre](https://elysiatools.com/fr/tools/cell-counting-hemocytometer): Convertit les comptages bruts de la chambre de Neubauer améliorée en concentration : cellules/mL = (total comptées ÷ carrés) × dilution × 10⁴ (chaque carré de 1 mm² sous 0,1 mm de profondeur contient exactement 0,1 µL). Saisissez le total compté, le nombre de carrés (généralement 4 angles ou 5 avec le central) et la dilution ; facultativement le volume pour le total de cellules. Conseils selon la densité idéale de 20–100 cellules par carré. Sources : manuel Freshney, géométrie Neubauer. Uniquement à but éducatif.
- [Convertisseur de Densité Cellulaire (cellules/mL↔cellules/µL↔10⁶/mL↔10¹²/L)](https://elysiatools.com/fr/tools/cell-density-unit-converter): Conversion complète entre unités de densité cellulaire : cellules/L, cellules/mL, cellules/µL, 10³ cellules/µL, 10⁶ cellules/mL, 10⁹ cellules/L et 10¹² cellules/L. Couvre la culture cellulaire (p. ex. E. coli 5×10⁸ cellules/mL = 500 ×10⁶ cellules/mL) comme les comptes rendus d'hématologie (érythrocytes 4,9×10¹²/L = 4,9×10⁶ cellules/µL ; leucocytes 6,5×10⁹/L = 6 500 cellules/µL) et renvoie la table complète des unités. Outil compagnon : calculateur OD600.
- [Calculateur de temps de doublement cellulaire](https://elysiatools.com/fr/tools/cell-doubling-time): Calcule la cinétique de croissance exponentielle à partir de deux comptages : temps de doublement t_d = ln2 × t ÷ ln(Nₜ/N₀), nombre de doublements n = ln(Nₜ/N₀) ÷ ln2 et taux spécifique μ = ln(Nₜ/N₀)/t (h⁻¹). N₀ et Nₜ peuvent être des nombres de cellules ou des densités dans toute unité cohérente ; le temps accepte heures/jours/minutes. Suppose la phase exponentielle aux deux points (ensemencement sous-confluent, récolte avant l'inhibition de contact), sinon t_d sera surestimé ; repères HEK293/HeLa/CHO inclus. Source : manuel Freshney. Uniquement à but éducatif.
- [Calculateur de viabilité cellulaire au bleu de trypan](https://elysiatools.com/fr/tools/cell-viability-trypan-blue): Calcule la viabilité à partir des comptages cellules vivantes/mortes du test d'exclusion au bleu de trypan : viabilité % = vivantes ÷ (vivantes + mortes) × 100 ; concentration en vivantes = comptage × dilution × 10⁴ ÷ carrés. Le colorant ne traverse pas les membranes intactes : les cellules vivantes restent claires, les lésées se colorent en bleu profond. Fournit une lecture de l'état de la culture (≥90% saine, 70–90% acceptable, <70% stressée) et des conseils de protocole (compter en 3–5 min ; une exposition prolongée tue les cellules viables). Sources : Freshney, protocole de Strober. Uniquement à but éducatif.

## Exemples

- [Exemples de Traitement d'Images Web Python](https://elysiatools.com/fr/samples/web-image-processing-python): Exemples de traitement d'images Web Python utilisant PIL/Pillow incluant la lecture, l'enregistrement, le redimensionnement et la conversion de format
- [Exemples de Longueur et Distance](https://elysiatools.com/fr/samples/length-distance): Exemples educatifs pour comprendre les unites metriques et imperiales, lintuition des distances et les conversions courantes
- [Exemples de Traitement d'Images Android Java](https://elysiatools.com/fr/samples/android-image-processing-java): Exemples de traitement d'images Android Java incluant lecture/écriture, mise à l'échelle et conversion de format
- [Exemples de Traitement d'Images Android Kotlin](https://elysiatools.com/fr/samples/android-image-processing-kotlin): Exemples de traitement d'images Android Kotlin incluant lecture/écriture, mise à l'échelle et conversion de format

## Contenu associé

- [Outils d encodage et de conversion audio](https://elysiatools.com/fr/hubs/audio-convert): Comparez la conversion de formats audio, les changements de debit, la conversion de frequence d echantillonnage, les changements de codec et les exports dans un meme hub.
- [Outils de conversion de formats d image et d export anime](https://elysiatools.com/fr/hubs/image-convert): Comparez les convertisseurs d image pour JPG, PNG, GIF, AVIF, WebP, TIFF, ICO, base64 et les exports orientes animation dans un meme hub.
- [Outils d interchange JSON et de traduction de formats](https://elysiatools.com/fr/hubs/json-convert): Comparez les outils de conversion JSON pour CSV, YAML, TOML, GraphQL, XML, Markdown, Excel, BSON, EDN et d autres formats structures dans un meme hub.
- [Outils de conversion d'espaces colorimetriques pour web et impression](https://elysiatools.com/fr/hubs/design-convert): Des outils reunis pour conversion d'espaces colorimetriques entre web et impression dans un seul hub.
