# Calculateur de masse moléculaire de protéine (par séquence)

Calcule la masse moléculaire d'une protéine depuis sa séquence : MW = Σ masses moyennes des résidus + H₂O (18,01524 Da), avec la même table qu'ExPASy ProtParam (A 71,0788 … W 186,2132). L'entrée est insensible à la casse ; espaces et séparateurs * - . sont retirés ; les codes d'ambiguïté (B/J/O/U/X/Z) ne sont pas sommés mais comptés et signalés. Le résultat est la chaîne polypeptidique non modifiée : sans clivage du peptide signal, ponts disulfures (−2H par pont), PTM ni étiquettes. Renvoie kDa, masse moyenne par résidu et longueur. Sources : ExPASy ProtParam (Gasteiger 2005), handbook de Fasman. Uniquement à but éducatif.

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- **Catégorie:** Education

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## Présentation

Ce calculateur estime la masse moléculaire moyenne d’une protéine à partir de sa séquence d’acides aminés. Il utilise la table de masses moyennes des résidus d’ExPASy ProtParam, ajoute H₂O et fournit la masse en Da, en kDa, la longueur et la masse moyenne par résidu.

## Entrées

- **Séquence d'acides aminés** (textarea): One-letter amino-acid sequence (case-insensitive; spaces and * - . separators are ignored).
- **Décimales** (number)

## Quand l'utiliser

- Estimer rapidement la masse d’un peptide ou d’une chaîne polypeptidique à partir de sa séquence.
- Vérifier la masse théorique d’une construction contenant une séquence d’étiquette.
- Comparer une séquence avec une masse attendue avant une analyse biochimique ou pédagogique.

## Fonctionnement

- Saisissez une séquence d’acides aminés à une lettre, en majuscules ou en minuscules.
- Les espaces et séparateurs *, - et . sont automatiquement ignorés.
- Le calcul additionne les masses moyennes des résidus standards puis ajoute 18,01524 Da pour H₂O.
- Le résultat indique la masse en Da et en kDa, la longueur et la masse moyenne par résidu.

## Cas d'usage

- Calculer la masse théorique d’un peptide ou d’une protéine courte.
- Contrôler une séquence d’étiquette d’affinité avant une construction expérimentale.
- Effectuer un contrôle pédagogique de la table de masses des 20 acides aminés standards.

## Questions fréquentes

### Quelles séquences puis-je saisir ?

Saisissez une séquence d’acides aminés au format à une lettre, sans distinction entre majuscules et minuscules.

### Les espaces et les séparateurs sont-ils acceptés ?

Oui. Les espaces ainsi que les séparateurs *, - et . sont retirés avant le calcul.

### Comment les codes d’ambiguïté sont-ils traités ?

Les codes B, J, O, U, X et Z ne sont pas inclus dans la somme des masses, mais ils sont comptés et signalés.

### Le calcul inclut-il les modifications de la protéine ?

Non. Il concerne une chaîne polypeptidique non modifiée, sans clivage du peptide signal, ponts disulfures, PTM ni étiquette ajoutée.

### Puis-je choisir le nombre de décimales ?

Oui. Le nombre de décimales peut être réglé de 0 à 8, avec 2 décimales par défaut.

## Outils associés

- [Analyseur de composition en acides aminés](https://elysiatools.com/fr/tools/amino-acid-composition): Analyse la composition d'une séquence : comptages et pourcentages molaires de chacun des 20 acides aminés standards ; totaux par groupe (basiques K/R/H, acides D/E, aromatiques F/W/Y, soufrés C/M, aliphatiques A/I/L/V, amides N/Q, hydroxyles S/T, autres G/P) ; GRAVY selon les valeurs d'hydropathie de Kyte–Doolittle 1982 (>0 tendance hydrophobe, <0 hydrophile ; les globulaires solubles se situent entre −1 et +0,3) ; et la masse moléculaire via la table ProtParam. Les codes d'ambiguïté (B/J/O/U/X/Z) sont comptés à part et exclus des pourcentages. Sources : Kyte & Doolittle 1982, ExPASy ProtParam, Lehninger. Uniquement à but éducatif.
- [Simulateur de l'effet goulot d'étranglement (perte d'hétérozygotie)](https://elysiatools.com/fr/tools/bottleneck-effect-simulator): Simule la perte attendue d'hétérozygotie après un goulot d'étranglement (espérance déterministe). Sous dérive de Wright-Fisher idéale, H_{t+1} = H_t(1 − 1/(2N)) par génération, d'où H_final = H₀(1−1/2Nb)^t × (1−1/2Nr)^g ; la taille efficace harmonique Ne = (t+g)/(t/Nb + g/Nr) est dominée par le minimum ; F accumulé = 1 − H_final/H₀. Pour un allèle de fréquence p, la survie à UNE génération de goulot est 1 − (1−p)^(2Nb) ; les allèles rares disparaissent en premier. Cas classiques : éléphant de mer du Nord (~20 survivants vers 1890), guépard, nēnē d'Hawaï, bison d'Europe, atoll de Pingelap. Sources : Wright 1931, Nei et al. 1975, Hartl & Clark 2007, StatPearls. Usage éducatif uniquement.
- [Calculateur de longueur des fragments de restriction](https://elysiatools.com/fr/tools/restriction-fragment-length): Estime les tailles des fragments après digestion : un substrat circulaire avec n coupures produit n fragments (en bouclant l'origine), un linéaire en produit n+1. Le mode positions calcule les fragments exacts à partir de coordonnées séparées par des virgules ; le mode nombre de sites donne l'effectif et la moyenne pour une répartition uniforme. Inclut la fréquence attendue des sites dans l'ADN aléatoire : enzymes à 4 bases ~1 site/256 bp, à 6 bases ~1/4096 bp (REBASE/Sambrook), et des repères de résolution en agarose (<50 bp peut sortir du gel). Sources : Sambrook & Russell 3ᵉ éd., REBASE. Uniquement pour l'éducation.
- [Calculateur d'efficacité de transfection (taux GFP+)](https://elysiatools.com/fr/tools/transfection-efficiency): Calcule l'efficacité de transfection via le taux GFP+ : efficacité = cellules GFP+ ÷ total × 100. Le mode mesure unique ajoute un intervalle de confiance Wilson à 95% (plus fiable que l'approximation normale pour petits effectifs) ; le mode réplicats prend des comptages parallèles séparés par virgules et renvoie l'efficacité par puits, la moyenne et l'écart-type d'échantillon (n−1). Bandes d'interprétation : ≥70% excellent (lignes faciles HEK293/CHO), 30–70% bon, 10–30% modéré, <10% faible (envisager électroporation ou vecteurs viraux). Hypothèses : même seuil GFP, cellules mortes exclues, lecture au pic 24–72 h. Sources : Wilson 1927, Newcombe 1998, Kim & Eberwine 2010. Uniquement pour l'éducation.
- [Convertisseur de Vitesse Angulaire (rad/s / rpm / deg/s / Hz)](https://elysiatools.com/fr/tools/angular-velocity-converter): Conversion de vitesse angulaire : rad/s (base SI) ↔ tr/min (1=2π/60 rad/s) ↔ deg/s (1=π/180 rad/s) ↔ Hz (1 tour/s=2π rad/s). Ici Hz = tour par seconde. Conversion via rad/s avec les quatre équivalents. Réf. : vinyle 33⅓ tr/min≈3,49 rad/s, ralenti moteur ~800 tr/min≈83,8 rad/s.
- [Métabolisme de Base Étendu (comparaison de formules)](https://elysiatools.com/fr/tools/basal-metabolic-rate-ext): Calcule en parallèle les cinq équations classiques du métabolisme basal adulte avec moyenne et étendue : Mifflin-St Jeor (standard actuel ADA), Harris-Benedict original (1919, surestime ~5%), Harris-Benedict révisé (Roza & Shizgal 1984), Schofield (FAO/OMS/ONU 1985, par tranches d'âge ; surestime sous les tropiques et en cas d'obésité) et Katch-McArdle (masse maigre optionnelle : 370 + 21,6×MM). Résultats en kcal/jour avec notes sur l'origine des écarts. Complète le bmr-calculator à formule unique et l'outil tdee Mifflin seul. Sources : Mifflin 1990, Roza 1984, FAO/OMS/ONU 1985, ADA. Adultes sains 18–100 ans. Non un avis médical.
- [Estimation de la Confluence Cellulaire (méthode de grille)](https://elysiatools.com/fr/tools/confluency-estimator): Estime la confluence des cellules adhérentes par la méthode de la grille microscopique : confluence% = carrés occupés ÷ carrés totaux × 100 par champ. Accepte plusieurs champs et calcule la moyenne ± écart-type, l'étendue et l'interprétation de croissance (<10% clairsemée, 10–50% sub-confluente, 50–80% approche de la confluence, 80–95% quasi confluente, ≥95% confluente). Avec le temps de doublement, estime les heures jusqu'à la confluence cible : t = TD × log₂(cible/actuel). Comptez 3 à 5 champs ; repiquez à 70–90%.
- [Calculateur de Dimensionnement de Conduit (débit et vitesse)](https://elysiatools.com/fr/tools/duct-size-calculator): Dimensionne un conduit à partir du débit Q et de la vitesse de projet v : section A=Q/v. Circulaire : diamètre D=√(4A/π). Rectangulaire de rapport r=a/b : b=√(A/r), a=r·b, diamètre équivalent ASHRAE D_éq=1,30·(a·b)^0,625/(a+b)^0,25. Débit en m³/s/m³/h/CFM ; résultats en mm et pouces.

## Exemples

- [Exemples de Traitement d'Images Web Python](https://elysiatools.com/fr/samples/web-image-processing-python): Exemples de traitement d'images Web Python utilisant PIL/Pillow incluant la lecture, l'enregistrement, le redimensionnement et la conversion de format
- [Échantillons Audio FLAC Libres de Droits](https://elysiatools.com/fr/samples/flac-samples): Collection audio FLAC sans perte pour tests et développement, incluant sons de la nature et musique de méditation
- [Échantillons Audio WAV Libres de Droits](https://elysiatools.com/fr/samples/wav-samples): Collection audio WAV non compressé pour tests et développement, incluant sons de la nature et musique de méditation
- [Exemples de Traitement d'Images Android Java](https://elysiatools.com/fr/samples/android-image-processing-java): Exemples de traitement d'images Android Java incluant lecture/écriture, mise à l'échelle et conversion de format

## Contenu associé

- [Outils de quantification des protéines, cinétique enzymatique et analyse de séquences](https://elysiatools.com/fr/hubs/protein-quantification-enzyme-kinetics-sequence-tools): Planifiez des dosages de protéines, convertissez des concentrations et analysez séquences, activité, cinétique, inhibition et liaison dans un même flux de laboratoire.
- [Outils de codes-barres, QR et etiquettes](https://elysiatools.com/fr/hubs/barcode-utility): Regroupe dans un meme hub les outils de generation de codes-barres, creation et decodage QR, validation UPC/EAN, partage WiFi par QR et etiquettes imprimables.
- [Outils d encodage et de conversion audio](https://elysiatools.com/fr/hubs/audio-convert): Comparez la conversion de formats audio, les changements de debit, la conversion de frequence d echantillonnage, les changements de codec et les exports dans un meme hub.
- [Outils de conversion de formats d image et d export anime](https://elysiatools.com/fr/hubs/image-convert): Comparez les convertisseurs d image pour JPG, PNG, GIF, AVIF, WebP, TIFF, ICO, base64 et les exports orientes animation dans un meme hub.
