# Calculateur de Tm d'oligonucléotides (correction saline) Deux estimations classiques du Tm : la règle de Wallace Tm = 2×(A+T) + 4×(G+C) (oligos courts <14 nt, sans dépendance au sel) et la formule corrigée du sel Tm = 81.5 + 16.6×log₁₀[Na⁺] + 0.41×(%G+C) − 600/n (Sambrook 1989 p. 11.46, la même que Primer3 ; le terme de longueur varie de 500 à 675/n selon les sources). Le mode automatique choisit selon la longueur. Renvoie %GC, composition et les deux estimations. Ce sont des approximations — pour une précision de conception, utiliser la thermodynamique plus proches voisins (outil pcr-primer-tm). Hypothèses : ADN, sans mésappariement, sans formamide/DMSO, [Na⁺] 0.01–1 M. Sources : Wallace 1979, von Ahsen 2001, Sambrook & Maniatis, OligoCalc. Uniquement pour l'éducation. > Page canonique: https://elysiatools.com/fr/tools/oligo-melting-temperature - **Catégorie:** Education - **Mots-clés:** calculateur tm oligo, température fusion correction saline, règle wallace tm, tm 81.5 16.6 log sodium, contenu gc oligonucléotide, estimation tm amorce, température hybridation, tm oligo court, formule tm sambrook, biologie moléculaire, calculateur laboratoire ## Présentation Ce calculateur estime la température de fusion (Tm) d’un oligonucléotide d’ADN à partir de sa séquence, de sa longueur et de la concentration en sodium. Il fournit le pourcentage de GC, la composition en bases, la règle de Wallace et la formule corrigée du sel, avec sélection automatique de la méthode selon la longueur. ## Entrées - **Séquence de l'oligonucléotide (5'→3')** (text): DNA sequence, A/C/G/T only (spaces stripped, case-insensitive), 4–200 nt. - **Méthode de Tm** (select): Auto uses Wallace below 14 nt and the salt-corrected formula from 14 nt up. - **Concentration de sodium (mM)** (number): Total \[Na⁺\] (or equivalent monovalent) of the buffer; used by the salt-corrected formula. - **Décimales** (number) ## Quand l'utiliser - Obtenir rapidement une estimation de Tm pour un oligonucléotide d’ADN de 4 à 200 nucléotides. - Comparer la règle de Wallace avec la formule de Tm corrigée selon la concentration en sodium. - Vérifier le pourcentage de GC et la composition d’une séquence avant une étape de planification expérimentale. ## Fonctionnement - Saisissez une séquence d’ADN composée uniquement de A, C, G et T, entre 4 et 200 nucléotides. Les espaces sont supprimés et les minuscules sont acceptées. - Indiquez la méthode souhaitée : automatique, Wallace ou formule corrigée du sel, puis renseignez la concentration totale en sodium en mM. - En mode automatique, la règle de Wallace est utilisée sous 14 nt et la formule corrigée du sel à partir de 14 nt. - Le résultat renvoie la Tm estimée, la méthode utilisée, la longueur, le pourcentage de GC, la composition et les deux estimations de Tm. ## Cas d'usage - Comparer rapidement la Tm de courtes sondes ou séquences d’ADN. - Évaluer l’effet du pourcentage de GC et de la concentration saline sur une estimation de Tm. - Préparer un exercice de biologie moléculaire sur l’hybridation et la température de fusion. ## Questions fréquentes ### Quelles séquences puis-je saisir ? Une séquence d’ADN de 4 à 200 nt contenant uniquement A, C, G et T. Les espaces sont supprimés automatiquement. ### Quelle formule est utilisée en mode automatique ? Wallace est utilisée sous 14 nt ; la formule corrigée du sel est utilisée à partir de 14 nt. ### Pourquoi renseigner la concentration en sodium ? Elle intervient dans la formule corrigée du sel et doit représenter le sodium total, ou un équivalent monovalent, du tampon. ### Le résultat convient-il pour concevoir une amorce ? Il s’agit d’une approximation éducative. Pour une conception précise, utilisez une méthode thermodynamique des plus proches voisins. ### Quelles sont les hypothèses du calcul ? Le calcul suppose de l’ADN sans mésappariement, sans formamide ni DMSO, avec une concentration en sodium comprise entre 0,01 et 1 M. ## Outils associés - [Calculateur de température d'hybridation PCR (Ta = Tm − 5°C)](https://elysiatools.com/fr/tools/annealing-temperature-calculator): Calcule la température d'hybridation (Ta) de la PCR selon deux règles : la règle simple de paillasse Ta = Tm − 5°C (en prenant le PLUS PETIT Tm de la paire d'amorces) et la formule empirique de Rychlik 1990 : Ta = 0.3×Tm(amorce) + 0.7×Tm(produit) − 14.9 (le Tm du produit est typiquement de 75–90°C et la formule tombe 1–8°C au-dessus de la règle simple pour des paires classiques). Fournit la Ta recommandée, une plage de gradient ±3°C et le sens d'ajustement : Ta trop basse donne bandes non spécifiques et dimères, trop haute aucun produit ; gardez les deux Tm à 2–3°C près et hybridez sur le plus petit. Sources : Rychlik 1990, Innis & Gelfand 1990, Lorenz 2012. Uniquement pour la planification. - [Analyseur de pedigree d'hérédité autosomique dominante](https://elysiatools.com/fr/tools/autosomal-dominant-pedigree): Calcule le risque pour la descendance dans l'hérédité autosomique dominante (AD) et évalue l'ajustement des effectifs observés au ratio attendu. Génotypes parentaux → ratio attendu : AA × n'importe = tous atteints ; Aa × Aa = 3:1 (75%) ; Aa × aa = 1:1 (50%) ; aa × aa = aucun. Les effectifs observés permettent un test du chi-carré (df = 1, critique 3.841). Signes du pedigree AD : transmission verticale, deux sexes atteints à parts égales, transmission homme-homme présente (exclut le dominant lié à l'X), les non-atteints ne transmettent pas (sauf mutation de novo). Exemples : Huntington, achondroplasie, Marfan. Sources : Griffiths, Hartl & Clark 2007, StatPearls, OMIM. Usage éducatif uniquement. - [Calculateur de risque d'hérédité autosomique récessive](https://elysiatools.com/fr/tools/autosomal-recessive-risk): Calcule la probabilité qu'un enfant (ou qu'au moins un de n enfants) soit atteint d'une maladie autosomique récessive. Un enfant atteint (aa) doit recevoir un allèle récessif de CHACUN des parents : P(enfant atteint) = P(parent 1 transmet a) × P(parent 2 transmet a). Statuts : porteur (Aa), atteint (aa), non porteur (AA), inconnu (P(Aa)=c, P(aa)=c² selon la fréquence populationnelle). Deux porteurs → 25% par enfant, 50% porteurs, P(porteur | non atteint) = 2/3 ; au moins un atteint parmi n = 1 − (1−r)^n. Défaut 0.04 (mucoviscidose 1/25). Sources : Griffiths, Hartl & Clark 2007, StatPearls. Usage éducatif uniquement, ne remplace pas un conseil génétique. - [Calculateur de numération cellulaire à l'hémocytomètre](https://elysiatools.com/fr/tools/cell-counting-hemocytometer): Convertit les comptages bruts de la chambre de Neubauer améliorée en concentration : cellules/mL = (total comptées ÷ carrés) × dilution × 10⁴ (chaque carré de 1 mm² sous 0,1 mm de profondeur contient exactement 0,1 µL). Saisissez le total compté, le nombre de carrés (généralement 4 angles ou 5 avec le central) et la dilution ; facultativement le volume pour le total de cellules. Conseils selon la densité idéale de 20–100 cellules par carré. Sources : manuel Freshney, géométrie Neubauer. Uniquement à but éducatif. - [Calculateur de temps de doublement cellulaire](https://elysiatools.com/fr/tools/cell-doubling-time): Calcule la cinétique de croissance exponentielle à partir de deux comptages : temps de doublement t_d = ln2 × t ÷ ln(Nₜ/N₀), nombre de doublements n = ln(Nₜ/N₀) ÷ ln2 et taux spécifique μ = ln(Nₜ/N₀)/t (h⁻¹). N₀ et Nₜ peuvent être des nombres de cellules ou des densités dans toute unité cohérente ; le temps accepte heures/jours/minutes. Suppose la phase exponentielle aux deux points (ensemencement sous-confluent, récolte avant l'inhibition de contact), sinon t_d sera surestimé ; repères HEK293/HeLa/CHO inclus. Source : manuel Freshney. Uniquement à but éducatif. - [Calculateur de viabilité cellulaire au bleu de trypan](https://elysiatools.com/fr/tools/cell-viability-trypan-blue): Calcule la viabilité à partir des comptages cellules vivantes/mortes du test d'exclusion au bleu de trypan : viabilité % = vivantes ÷ (vivantes + mortes) × 100 ; concentration en vivantes = comptage × dilution × 10⁴ ÷ carrés. Le colorant ne traverse pas les membranes intactes : les cellules vivantes restent claires, les lésées se colorent en bleu profond. Fournit une lecture de l'état de la culture (≥90% saine, 70–90% acceptable, <70% stressée) et des conseils de protocole (compter en 3–5 min ; une exposition prolongée tue les cellules viables). Sources : Freshney, protocole de Strober. Uniquement à but éducatif. - [Calculateur d'UFC/mL (unités formatrices de colonie)](https://elysiatools.com/fr/tools/cfu-calculator): Convertit le dénombrement des colonies en concentration de la culture d'origine : UFC/mL = colonies × 10ⁿ ÷ volume ensemencé (mL), la boîte ayant été ensemencée depuis le tube 10⁻ⁿ. Intègre la règle de la fourchette comptable 30–300 colonies par boîte : >300 signale un TFTC (trop nombreuses, augmenter la dilution), <30 signale un dénombrement trop faible (diminuer la dilution) et 0 colonie donne la limite de détection ; conversion en UFC totales optionnelle. Sources : Standard Methods, FDA BAM. Uniquement à but éducatif. - [Calculateur de nombre de copies d'ADN (concentration → copies)](https://elysiatools.com/fr/tools/dna-copy-number-calculator): Convertit une concentration massique d'ADN en copies moléculaires par microlitre : copies/µL = c(g/µL) × N_A ÷ (longueur pb × 660 g/mol). Accepte ng/µL (sortie NanoDrop habituelle, identique à µg/mL), pg/µL (gamme Qubit) et µg/µL ; fournit la conversion en pmol/µL et le total de copies dans un volume optionnel. Repère : un plasmide de 5 000 pb à 50 ng/µL → 9.12×10⁹ copies/µL (0.0152 pmol/µL). Rappels : 660 Da/pb est une moyenne suffisante pour plasmides/génome/amplicons (pour des oligos exacts, sommez les masses des bases) ; l'A260 surestime les échantillons contaminés par ARN/nucléotides libres — pour la précision, préférez un dosage fluorométrique. Sources : N_A SI 2019, convention Thermo Fisher, Sambrook & Russell. Uniquement pour la planification. ## Exemples - [Exemples de Traitement d'Images Web Python](https://elysiatools.com/fr/samples/web-image-processing-python): Exemples de traitement d'images Web Python utilisant PIL/Pillow incluant la lecture, l'enregistrement, le redimensionnement et la conversion de format - [Exemples de Traitement d'Images Android Java](https://elysiatools.com/fr/samples/android-image-processing-java): Exemples de traitement d'images Android Java incluant lecture/écriture, mise à l'échelle et conversion de format - [Exemples de Traitement d'Images Android Kotlin](https://elysiatools.com/fr/samples/android-image-processing-kotlin): Exemples de traitement d'images Android Kotlin incluant lecture/écriture, mise à l'échelle et conversion de format - [Exemples de Traitement d'Images Web Rust](https://elysiatools.com/fr/samples/web-image-processing-rust): Exemples de traitement d'images Web Rust incluant lecture/écriture, redimensionnement et conversion de format ## Contenu associé - [Outils d encodage et de conversion audio](https://elysiatools.com/fr/hubs/audio-convert): Comparez la conversion de formats audio, les changements de debit, la conversion de frequence d echantillonnage, les changements de codec et les exports dans un meme hub. - [Outils de conversion de formats d image et d export anime](https://elysiatools.com/fr/hubs/image-convert): Comparez les convertisseurs d image pour JPG, PNG, GIF, AVIF, WebP, TIFF, ICO, base64 et les exports orientes animation dans un meme hub. - [Outils d interchange JSON et de traduction de formats](https://elysiatools.com/fr/hubs/json-convert): Comparez les outils de conversion JSON pour CSV, YAML, TOML, GraphQL, XML, Markdown, Excel, BSON, EDN et d autres formats structures dans un meme hub. - [Outils de conversion d'espaces colorimetriques pour web et impression](https://elysiatools.com/fr/hubs/design-convert): Des outils reunis pour conversion d'espaces colorimetriques entre web et impression dans un seul hub.