# Calculadora del coeficiente de extinción proteico (ε280) Calcula ε280 según Pace 1995 / Gill & von Hippel 1989: ε280 = 5500×nTrp + 1490×nTyr + 125×ncistina (M⁻¹cm⁻¹, error típico ±5%). Las cistinas son pares de Cys unidos por puente disulfuro y solo cuentan en estado oxidado (⌊Cys/2⌋); la herramienta devuelve los valores totalmente reducido y totalmente oxidado para acotar el estado real. El modo secuencia cuenta W/Y/C y calcula el peso molecular con las masas medias de ProtParam; el modo recuento toma números de residuos y un peso opcional. Incluye A0.1% = ε/PM (absorbancia de 1 mg/mL), es decir c = A/ε para volver de la lectura al concentrado. Ojo: proteínas sin Trp/Tyr tienen ε280 casi nulo (use A205 o BCA) y corrija la contaminación de ácidos nucleicos (A260). Fuentes: Pace 1995, Gill & von Hippel 1989, ExPASy ProtParam. Solo para educación. > Página canónica: https://elysiatools.com/es/tools/protein-extinction-coefficient - **Categoría:** Education - **Palabras clave:** calculadora coeficiente extinción proteína, épsilon 280 proteína, calculadora concentración a280, absorbancia trp tyr cistina, coeficiente extinción pace 1995, extinción gill von hippel, coeficiente extinción protparam, coeficiente absorción molar, absorbancia a0.1% 1 mg/ml, biología molecular, calculadora laboratorio ## Descripción general Calcula el coeficiente de extinción proteico ε280 a partir de una secuencia o del recuento de Trp, Tyr y Cys. La herramienta muestra los valores para cisteínas reducidas y oxidadas, el peso molecular en modo secuencia y A0.1% cuando se dispone del peso molecular. ## Entradas - **Modo de entrada** (select): Count W/Y/C from a sequence, or enter residue counts directly. - **Secuencia de proteína (códigos de una letra)** (textarea): One-letter codes, 20 standard residues (FASTA headers, whitespace, and '*' are stripped); sequence mode. - **Número de triptófanos (Trp)** (number): Number of tryptophans (counts mode); each contributes 5500 M⁻¹cm⁻¹. - **Número de tirosinas (Tyr)** (number): Number of tyrosines (counts mode); each contributes 1490 M⁻¹cm⁻¹. - **Número de cisteínas (Cys)** (number): Number of cysteines (counts mode); each disulfide pair contributes 125 M⁻¹cm⁻¹ when oxidized. - **Estado de las cisteínas** (select): Reduced cysteines contribute nothing; oxidized pairs (cystines) add 125 each. - **Peso molecular (kDa, modo recuento)** (number): Protein molecular weight for the A0.1% conversion in counts mode; 0 skips it. - **Decimales** (number) ## Cuándo usarlo - Estimar ε280 antes de medir la concentración de una proteína por absorbancia a 280 nm. - Comparar los valores de ε280 en estados totalmente reducido y totalmente oxidado. - Convertir el coeficiente de extinción en A0.1% para una solución de 1 mg/mL. ## Cómo funciona - Elige el modo de entrada: secuencia de proteína o recuento de residuos. - En modo secuencia, introduce códigos de una letra; se cuentan automáticamente W, Y y C y se calcula el peso molecular. - En modo recuento, introduce el número de Trp, Tyr y Cys y, opcionalmente, el peso molecular en kDa. - La herramienta aplica ε280 = 5500×Trp + 1490×Tyr + 125×cistina y devuelve los valores reducido, oxidado y A0.1% cuando corresponde. ## Casos de uso - Planificación de mediciones de concentración en proteínas purificadas. - Estimación rápida de ε280 para péptidos y proteínas a partir de su secuencia. - Evaluación del efecto de los puentes disulfuro sobre la absorbancia calculada. ## Preguntas frecuentes ### ¿Qué residuos contribuyen al ε280? Trp aporta 5500, Tyr 1490 y cada cistina oxidada 125 M⁻¹cm⁻¹. ### ¿Cómo se cuentan las cisteínas oxidadas? Se cuentan como pares: ⌊Cys/2⌋. Las cisteínas reducidas no aportan al cálculo. ### ¿Qué diferencia hay entre los modos secuencia y recuento? El modo secuencia cuenta W, Y y C automáticamente; el modo recuento requiere introducir esos números. ### ¿Qué es A0.1%? Es ε dividido por el peso molecular y representa la absorbancia de una solución de 1 mg/mL. ### ¿Es adecuado ε280 para cualquier proteína? No. Las proteínas sin Trp ni Tyr tienen ε280 casi nulo; puede ser preferible A205 o BCA. ## Herramientas relacionadas - [Calculadora de temperatura de anillado PCR (Ta = Tm − 5°C)](https://elysiatools.com/es/tools/annealing-temperature-calculator): Calcula la temperatura de anillado (Ta) de la PCR con dos reglas: la regla simple de banco Ta = Tm − 5°C (tomando el MENOR Tm del par de cebadores) y la fórmula empírica de Rychlik 1990: Ta = 0.3×Tm(cebador) + 0.7×Tm(producto) − 14.9 (el Tm del producto suele ser 75–90°C y la fórmula cae 1–8°C por encima de la regla simple en pares típicos). Entrega la Ta recomendada, un rango de gradiente ±3°C y la dirección de ajuste: Ta baja produce bandas inespecíficas y dímeros, Ta alta sin producto; mantenga los dos Tm dentro de 2–3°C y anille con el menor. Fuentes: Rychlik 1990, Innis & Gelfand 1990, Lorenz 2012. Solo planificación experimental. - [Analizador de pedigrees de herencia autosómica dominante](https://elysiatools.com/es/tools/autosomal-dominant-pedigree): Calcula el riesgo en la descendencia para herencia autosómica dominante (AD) y evalúa el ajuste de los conteos observados a la proporción esperada. Genotipos parentales → proporción esperada: AA × cualquiera = todos afectados; Aa × Aa = 3:1 (75%); Aa × aa = 1:1 (50%); aa × aa = ninguno. Los conteos observados admiten una prueba chi-cuadrado (df = 1, crítico 3.841). Rasgos del pedigree AD: transmisión vertical, ambos sexos afectados por igual, existe transmisión hombre-a-hombre (excluye el dominante ligado al X), los no afectados no transmiten (salvo mutación de novo). Enfermedades ejemplo: Huntington, acondroplasia, Marfan. Fuentes: Griffiths, Hartl & Clark 2007, StatPearls, OMIM. Solo uso educativo. - [Calculadora de riesgo de herencia autosómica recesiva](https://elysiatools.com/es/tools/autosomal-recessive-risk): Calcula la probabilidad de que un hijo (o al menos uno de n hijos) padezca una enfermedad autosómica recesiva. Un hijo afectado (aa) debe recibir un alelo recesivo de AMBOS progenitores: P(hijo afectado) = P(progenitor 1 transmite a) × P(progenitor 2 transmite a). Estados: portador (Aa), afectado (aa), no portador (AA), desconocido (P(Aa)=c, P(aa)=c² por frecuencia poblacional). Dos portadores → 25% por hijo, 50% portadores, P(portador | no afectado) = 2/3; al menos uno de n afectados = 1 − (1−r)^n. Portadores por defecto 0.04 (fibrosis quística 1/25). Fuentes: Griffiths, Hartl & Clark 2007, StatPearls. Solo uso educativo, no sustituye la consejería genética. - [Calculadora de recuento celular en cámara de Neubauer](https://elysiatools.com/es/tools/cell-counting-hemocytometer): Convierte recuentos brutos de la cámara de Neubauer mejorada en concentración: células/mL = (total contadas ÷ cuadrículos) × dilución × 10⁴ (cada cuadrículo de 1 mm² con profundidad de 0,1 mm contiene exactamente 0,1 µL). Introduzca el total contado, el número de cuadrículos (normalmente 4 esquinas o 5 con el central) y la dilución; opcionalmente el volumen para el total de células. Incluye consejos según la densidad ideal de 20–100 células por cuadrículo. Fuentes: manual de Freshney, geometría Neubauer mejorada. Solo para educación. - [Calculadora de tiempo de duplicación celular](https://elysiatools.com/es/tools/cell-doubling-time): Calcula la cinética de crecimiento exponencial a partir de dos recuentos: tiempo de duplicación t_d = ln2 × t ÷ ln(Nₜ/N₀), junto con el número de duplicaciones n = ln(Nₜ/N₀) ÷ ln2 y la tasa específica μ = ln(Nₜ/N₀)/t (h⁻¹). N₀ y Nₜ pueden ser números de células o densidades en cualquier unidad consistente; el tiempo acepta horas/días/minutos. Supone fase logarítmica en ambos puntos (siembra subconfluente, cosecha antes de la inhibición por contacto), de lo contrario t_d saldrá alto; incluye referencias de HEK293/HeLa/CHO. Fuente: manual Freshney. Solo para educación. - [Calculadora de viabilidad celular con azul de tripán](https://elysiatools.com/es/tools/cell-viability-trypan-blue): Calcula la viabilidad a partir de los recuentos de células vivas/muertas en el ensayo de exclusión del azul de tripán: viabilidad % = vivas ÷ (vivas + muertas) × 100; concentración de vivas = recuento × dilución × 10⁴ ÷ cuadrículos. El colorante no atraviesa membranas intactas: las vivas quedan brillantes y las dañadas se tiñen azul intenso. Incluye interpretación del estado del cultivo (≥90% sano, 70–90% aceptable, <70% estresado) y consejos de protocolo (contar en 3–5 min; la exposición prolongada mata células viables). Fuentes: Freshney, ensayo de Strober. Solo para educación. - [Calculadora de UFC/mL (unidades formadoras de colonias)](https://elysiatools.com/es/tools/cfu-calculator): Convierte el recuento de colonias en la concentración original: UFC/mL = colonias × 10ⁿ ÷ volumen sembrado (mL), donde la placa se sembró desde el tubo 10⁻ⁿ. Incluye la regla del rango contable 30–300 colonias/placa: >300 señala TNTC (demasiadas numerosas, subir dilución), <30 señala TFTC (demasiadas pocas, bajar dilución) y 0 colonias da el límite de detección; opcionalmente convierte a UFC totales por volumen. Fuentes: Standard Methods, FDA BAM. Solo para educación. - [Calculadora de número de copias de ADN (concentración → copias)](https://elysiatools.com/es/tools/dna-copy-number-calculator): Convierte la concentración másica de ADN en copias moleculares por microlitro: copias/µL = c(g/µL) × N_A ÷ (longitud pb × 660 g/mol). Admite ng/µL (salida típica de NanoDrop, idéntico a µg/mL), pg/µL (rango Qubit) y µg/µL; incluye la conversión a pmol/µL y el total de copias en un volumen opcional. Referencia: un plásmido de 5.000 pb a 50 ng/µL → 9.12×10⁹ copias/µL (0.0152 pmol/µL). Recordatorios: 660 Da/pb es un promedio suficiente para plásmidos/genoma/amplicones (para oligos exactos sume masa por base); el A260 sobreestima muestras con ARN/nucleótidos libres — para exactitud use ensayo con fluoróforo. Fuentes: constante de Avogadro SI 2019, convención Thermo Fisher, Sambrook & Russell. Solo planificación. ## Ejemplos - [Ejemplos de Procesamiento de Imágenes Web Python](https://elysiatools.com/es/samples/web-image-processing-python): Ejemplos de procesamiento de imágenes Web Python usando PIL/Pillow incluyendo lectura, guardado, redimensionamiento y conversión de formato - [Ejemplos de Procesamiento de Imágenes Android Java](https://elysiatools.com/es/samples/android-image-processing-java): Ejemplos de procesamiento de imágenes Android Java incluyendo lectura/escritura, escalado y conversión de formato - [Ejemplos de Procesamiento de Imágenes Android Kotlin](https://elysiatools.com/es/samples/android-image-processing-kotlin): Ejemplos de procesamiento de imágenes Android Kotlin incluyendo lectura/escritura, escalado y conversión de formato - [Ejemplos de Procesamiento de Imágenes Web Rust](https://elysiatools.com/es/samples/web-image-processing-rust): Ejemplos de procesamiento de imágenes Web Rust incluyendo lectura/escritura, escalado y conversión de formato ## Contenido relacionado - [Herramientas de cuantificación de proteínas, cinética enzimática y análisis de secuencias](https://elysiatools.com/es/hubs/protein-quantification-enzyme-kinetics-sequence-tools): Planifica ensayos de proteínas, convierte concentraciones y analiza secuencias, actividad, cinética, inhibición y unión en un solo flujo de laboratorio. - [Herramientas de codificacion y conversion de audio](https://elysiatools.com/es/hubs/audio-convert): Compara conversion de formatos de audio, cambios de bitrate, conversion de frecuencia de muestreo, cambio de codec y exportacion en un solo hub. - [Herramientas de conversion de formatos de imagen y exportacion animada](https://elysiatools.com/es/hubs/image-convert): Compara convertidores de imagen para JPG, PNG, GIF, AVIF, WebP, TIFF, ICO, base64 y salidas pensadas para animacion en un solo hub. - [Herramientas de intercambio JSON y traduccion de formatos](https://elysiatools.com/es/hubs/json-convert): Compara herramientas de conversion JSON para CSV, YAML, TOML, GraphQL, XML, Markdown, Excel, BSON, EDN y otros formatos estructurados en un solo hub.