# Calculadora de Tm de oligonucleótidos (corrección por sal)

Dos estimaciones clásicas de Tm: la regla de Wallace Tm = 2×(A+T) + 4×(G+C) (oligos cortos <14 nt, sin dependencia de sal) y la fórmula con corrección por sal Tm = 81.5 + 16.6×log₁₀[Na⁺] + 0.41×(%G+C) − 600/n (Sambrook 1989 p.11.46, la misma de Primer3; el término de longitud varía 500–675/n según la fuente). El modo automático elige por longitud. Devuelve %GC, composición y ambas estimaciones. Son aproximaciones — para precisión de diseño use termodinámica de vecinos más cercanos (herramienta pcr-primer-tm). Supuestos: ADN, sin desapareamientos, sin formamida/DMSO, [Na⁺] 0.01–1 M. Fuentes: Wallace 1979, von Ahsen 2001, Sambrook & Maniatis, OligoCalc. Solo para educación.

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- **Categoría:** Education

- **Palabras clave:** calculadora tm oligo, temperatura fusión corrección sal, regla wallace tm, tm 81.5 16.6 log sodio, contenido gc oligonucleótido, estimación tm primer, temperatura hibridación, tm oligo corto, fórmula tm sambrook, biología molecular, calculadora laboratorio

## Descripción general

Calcula una estimación de la temperatura de fusión (Tm) de un oligonucleótido de ADN a partir de su secuencia, longitud, contenido GC y concentración de sodio. Incluye la regla de Wallace, una fórmula con corrección por sal y un modo automático que selecciona el método según la longitud.

## Entradas

- **Secuencia del oligonucleótido (5'→3')** (text): DNA sequence, A/C/G/T only (spaces stripped, case-insensitive), 4–200 nt.
- **Método de Tm** (select): Auto uses Wallace below 14 nt and the salt-corrected formula from 14 nt up.
- **Concentración de sodio (mM)** (number): Total \[Na⁺\] (or equivalent monovalent) of the buffer; used by the salt-corrected formula.
- **Decimales** (number)

## Cuándo usarlo

- Estimar rápidamente la Tm de un oligonucleótido de ADN de 4 a 200 nucleótidos.
- Comparar la estimación de Wallace con la fórmula de Tm corregida por concentración de sodio.
- Consultar el contenido GC, la composición de bases y la Tm calculada para una planificación experimental educativa.

## Cómo funciona

- Introduce una secuencia de ADN formada por A, C, G y T; los espacios se eliminan y las minúsculas se aceptan.
- Selecciona el método: automático, regla de Wallace o fórmula con corrección por sal.
- Indica la concentración total de sodio del tampón en mM, especialmente cuando uses la fórmula corregida por sal.
- La herramienta devuelve la longitud, el porcentaje GC, la composición, ambas estimaciones y el método utilizado, con los decimales elegidos.

## Casos de uso

- Clases de biología molecular para relacionar longitud, composición GC y temperatura de fusión.
- Planificación preliminar de sondas u oligonucleótidos de ADN antes de realizar cálculos más avanzados.
- Comparación del efecto de distintas concentraciones de sodio sobre la Tm estimada.

## Preguntas frecuentes

### ¿Qué secuencias acepta la calculadora?

Acepta secuencias de ADN de 4 a 200 nt compuestas únicamente por A, C, G y T. También admite espacios y minúsculas.

### ¿Qué método selecciona el modo automático?

Usa la regla de Wallace para oligonucleótidos de menos de 14 nt y la fórmula con corrección por sal a partir de 14 nt.

### ¿Cómo influye la concentración de sodio?

La concentración de sodio se usa en la fórmula corregida por sal. En este cálculo, una concentración menor suele producir una Tm estimada más baja.

### ¿Qué resultados muestra?

Muestra la Tm seleccionada, el método utilizado, el porcentaje GC, la longitud, la composición de bases y las estimaciones de Wallace y corregida por sal.

### ¿Estas estimaciones sirven para diseñar cebadores con precisión?

No. Son aproximaciones educativas; para diseño preciso se recomienda un cálculo termodinámico de vecinos más cercanos.

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