# Calculadora de puntaje LOD (análisis de ligamiento)

Análisis de ligamiento de dos puntos mediante puntajes LOD: LOD(θ) = log10[θ^r(1−θ)^(N−r) / 0.5^N], con r meiosis recombinantes y N meiosis informativas totales. La estimación de máxima verosimilitud es θ̂ = r/N; calcula el LOD máximo (Zmax) o el LOD en un θ fijo, con tabla de la curva LOD para θ = 0.05–0.45. Umbrales clásicos (Morton 1955): Z ≥ 3 evidencia significativa de ligamiento (1000:1); Z ≤ −2 evidencia significativa en contra; entre ambos, inconcluso. Fuentes: Morton 1955, Ott 1999, Griffiths, StatPearls. Solo uso educativo.

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- **Categoría:** Education

- **Palabras clave:** puntaje lod, calculadora de lod, análisis de ligamiento, ligamiento genético, fracción de recombinación, estimación de theta, logaritmo de probabilidades, mapeo génico, ligamiento de dos puntos, genética mendeliana, genética

## Descripción general

La calculadora de puntaje LOD realiza un análisis de ligamiento genético de dos puntos a partir de meiosis recombinantes y no recombinantes. Estima la fracción de recombinación θ, calcula el LOD máximo o el LOD en un θ fijo y muestra una tabla de la curva LOD para θ entre 0,05 y 0,45. Uso exclusivamente educativo.

## Entradas

- **Modo de θ** (select): Report the maximum LOD at θ̂ = r/N, or evaluate the LOD at a fixed θ.
- **Recombinantes** (number): Number of recombinant meioses observed (r).
- **No recombinantes** (number): Number of non-recombinant meioses observed.
- **Fracción de recombinación θ** (number): Recombination fraction at which to evaluate the LOD in fixed-θ mode (0 < θ < 0.5).
- **Decimales** (number)

## Cuándo usarlo

- Cuando necesitas estimar la fracción de recombinación a partir de un número observado de meiosis recombinantes.
- Cuando quieres evaluar la evidencia de ligamiento en un valor específico de θ, como 0,10.
- Cuando deseas interpretar un puntaje LOD mediante los umbrales clásicos de apoyo, rechazo o resultado inconcluso.

## Cómo funciona

- Introduce el número de meiosis recombinantes y no recombinantes.
- Elige entre calcular el LOD máximo, con θ̂ = r/N, o evaluar el LOD en un θ fijo entre 0 y 0,5.
- La herramienta aplica LOD(θ) = log10\[θ^r(1−θ)^(N−r) / 0,5^N\] y redondea el resultado según los decimales indicados.
- Devuelve el puntaje calculado, la conclusión correspondiente y una tabla de la curva LOD para θ de 0,05 a 0,45.

## Casos de uso

- Prácticas de genética mendeliana y análisis de ligamiento de dos puntos.
- Estimación de distancias genéticas aproximadas a partir de fracciones de recombinación.
- Comparación de hipótesis de ligamiento mediante puntajes LOD y valores de θ específicos.

## Preguntas frecuentes

### ¿Qué datos necesita la calculadora?

Necesita el número de meiosis recombinantes, el número de meiosis no recombinantes y el modo de cálculo de θ. En el modo fijo también requiere un valor de θ.

### ¿Qué representa θ̂?

Es la estimación de máxima verosimilitud de la fracción de recombinación y se calcula como θ̂ = r/N.

### ¿Cómo se interpreta un LOD de 3 o más?

Indica evidencia significativa de ligamiento, con una razón de verosimilitudes de al menos 1000:1.

### ¿Qué significa un LOD de −2 o menor?

Indica evidencia significativa en contra del ligamiento en el valor de θ evaluado.

### ¿Qué significa un LOD entre −2 y 3?

El resultado se considera inconcluso según los umbrales clásicos de Morton.

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