# Simulador del efecto cuello de botella (pérdida de heterocigosidad)

Simula la pérdida esperada de heterocigosidad tras un cuello de botella (esperanza determinista). Bajo deriva Wright-Fisher ideal, H_{t+1} = H_t(1 − 1/(2N)) por generación, luego H_final = H₀(1−1/2Nb)^t × (1−1/2Nr)^g; el tamaño efectivo por media armónica Ne = (t+g)/(t/Nb + g/Nr) queda dominado por el mínimo; F acumulado = 1 − H_final/H₀. Para un alelo de frecuencia p, la supervivencia a UNA generación de cuello es 1 − (1−p)^(2Nb); los alelos raros se pierden primero. Casos clásicos: foca elefante del norte (~20 supervivientes en 1890), guepardo, nēnē Hawái, bisonte europeo, atolón Pingelap. Fuentes: Wright 1931, Nei et al. 1975, Hartl & Clark 2007, StatPearls. Solo uso educativo.

> Página canónica: https://elysiatools.com/es/tools/bottleneck-effect-simulator

- **Categoría:** Education

- **Palabras clave:** efecto cuello de botella, cuello de botella poblacional, deriva genética, pérdida de heterocigosidad, tamaño efectivo, endogamia, diversidad genética, genética de la conservación, genética de poblaciones, genética

## Descripción general

Este simulador estima cómo un cuello de botella poblacional reduce la heterocigosidad bajo deriva Wright-Fisher ideal. Calcula la heterocigosidad final, la proporción retenida, el coeficiente de endogamia acumulado, el tamaño efectivo por media armónica y la supervivencia de un alelo focal durante una generación de cuello.

## Entradas

- **Heterocigosidad inicial H₀** (number): Heterozygosity before the bottleneck (0 < H₀ ≤ 1).
- **Tamaño de la población en el cuello de botella** (number): Census size during the bottleneck (Nb).
- **Generaciones del cuello de botella** (number): Number of generations spent at the bottleneck size (t).
- **Tamaño de la población en recuperación** (number): Census size after recovery (Nr).
- **Generaciones de recuperación** (number): Generations spent at the recovery size (g; 0 to skip).
- **Frecuencia del alelo focal** (number): Frequency p of a focal allele used for the one-generation bottleneck survival estimate.
- **Decimales** (number)

## Cuándo usarlo

- Para comparar la pérdida esperada de diversidad genética entre cuellos de botella de distinta intensidad y duración.
- Para estudiar por qué una recuperación numérica rápida no restaura necesariamente la heterocigosidad perdida.
- Para explorar cómo el tamaño del cuello afecta la supervivencia de alelos frecuentes o raros durante una generación.

## Cómo funciona

- Introduce la heterocigosidad inicial H₀, el tamaño de la población durante el cuello Nb y su duración en generaciones.
- Indica el tamaño de la población recuperada Nr y las generaciones de recuperación; usa 0 generaciones si deseas omitir esta fase.
- Añade la frecuencia p del alelo focal y selecciona el número de decimales del resultado.
- El simulador aplica H_final = H₀(1−1/2Nb)^t(1−1/2Nr)^g y devuelve los indicadores calculados en formato JSON.

## Casos de uso

- Clases de genética de poblaciones sobre deriva genética, endogamia y pérdida de heterocigosidad.
- Ejercicios de genética de la conservación para comparar escenarios de reducción y recuperación poblacional.
- Análisis didácticos sobre la vulnerabilidad de alelos raros ante cuellos de botella severos.

## Preguntas frecuentes

### ¿Qué representa la heterocigosidad final?

Es la diversidad genética esperada después de las fases de cuello de botella y recuperación.

### ¿La recuperación poblacional restaura la heterocigosidad perdida?

No en este modelo: un tamaño posterior grande frena pérdidas adicionales, pero no recupera la diversidad ya eliminada.

### ¿Qué significa el coeficiente F?

Mide la pérdida acumulada respecto a H₀ y se calcula como F = 1 − H_final/H₀.

### ¿Cómo se calcula la supervivencia del alelo focal?

Para una generación de cuello se estima como 1 − (1−p)^(2Nb).

### ¿El resultado predice exactamente una población real?

No. Es una esperanza determinista basada en deriva Wright-Fisher ideal y está destinada a uso educativo.

## Herramientas relacionadas

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