# Proteinfaltung-Energielandschaft

Erforschen Sie Proteinfaltung durch Energielandschaftstrichter, HP-Modell und freie Energieminimierung

> Kanonische Seite: https://elysiatools.com/de/visualizations/protein-folding-energy-landscape

- **Kategorie:** Chemistry

## Überblick

Interactive protein folding energy landscape visualization using the HP lattice model (Dill 1985). Explore how hydrophobic collapse drives protein folding through a funnel-shaped free energy landscape. Four panels: (1) 2D HP lattice showing chain conformation with hydrophobic (H, orange) and polar (P, blue) residues, H-H contact lines, and bond connectivity; (2) Energy landscape funnel visualization with trajectory overlay showing the random walk descending toward the native state; (3) Energy vs simulation step time series with minimum energy reference line; (4) Energy distribution histogram with current state marker. Monte Carlo simulation with Metropolis criterion: corner flips and end rotations on a 20x20 square lattice. Adjustable parameters: chain length (6-24 residues), hydrophobic ratio (20-80%), temperature (50-600 K), hydrogen bond strength, HP contact energy, and sequence type (random, alternating, block). Five presets: Ideal (balanced folding), Frustrated (kinetic traps), Hot (thermal unfolding), Cold (kinetic trapping), Strong H-bond (fast convergence). Real-time statistics: current energy, step count, HP contacts, hydrogen bonds, minimum energy, radius of gyration Rg. Educational content covers protein folding problem (Anfinsen's dogma, thermodynamic hypothesis), energy landscape theory (funnel, ruggedness, frustration), HP model (NP-hard optimization, hydrophobic collapse), drug design (stabilizing native state, amyloid diseases), structure prediction (AlphaFold, CASP competition), and guided experiments. Multi-language support (zh, en, es, fr, de, ru, pt).

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