# Protein-Extinktionskoeffizienten-Rechner (ε280) Berechnet ε280 nach Pace 1995 / Gill & von Hippel 1989: ε280 = 5500×nTrp + 1490×nTyr + 125×nCystin (M⁻¹cm⁻¹, typische Genauigkeit ±5%). Cystine sind disulfidverbrückte Cys-Paare und zählen nur im oxidierten Zustand (⌊Cys/2⌋); das Tool liefert den voll-reduzierten und den voll-oxidierten Wert, um den realen Zustand einzugrenzen. Der Sequenzmodus zählt W/Y/C und berechnet die Molekülmasse mit den ProtParam-Durchschnittsmassen; der Zählmodus nimmt Restanzahlen und eine optionale Masse. Enthält A0.1% = ε/MW (Absorption von 1 mg/mL), also c = A/ε für den Rückschluss auf die Konzentration. Achtung: Proteine ohne Trp/Tyr haben nahezu null ε280 (A205 oder BCA verwenden) und Nukleinsäurekontamination (A260) korrigieren. Quellen: Pace 1995, Gill & von Hippel 1989, ExPASy ProtParam. Nur für Ausbildung. > Kanonische Seite: https://elysiatools.com/de/tools/protein-extinction-coefficient - **Kategorie:** Education - **Schlagwörter:** protein-extinktionskoeffizient-rechner, epsilon 280 protein, a280-konzentrationsrechner, absorption trp tyr cystin, extinktionskoeffizient pace 1995, extinktion gill von hippel, extinktionskoeffizient protparam, molarer absorptionkoeffizient, absorption a0.1% 1 mg/ml, molekularbiologie, labor-rechner ## Überblick Der Protein-Extinktionskoeffizienten-Rechner bestimmt ε280 aus einer Proteinsequenz oder aus direkten Restanzahlen. Er zählt Tryptophan, Tyrosin und Cystein, gibt Werte für den reduzierten und oxidierten Zustand aus und berechnet bei vorhandener Molekülmasse zusätzlich A0.1% für eine 1-mg/mL-Lösung. ## Eingaben - **Eingabemodus** (select): Count W/Y/C from a sequence, or enter residue counts directly. - **Proteinsequenz (Einbuchstaben-Codes)** (textarea): One-letter codes, 20 standard residues (FASTA headers, whitespace, and '*' are stripped); sequence mode. - **Anzahl Tryptophan (Trp)** (number): Number of tryptophans (counts mode); each contributes 5500 M⁻¹cm⁻¹. - **Anzahl Tyrosin (Tyr)** (number): Number of tyrosines (counts mode); each contributes 1490 M⁻¹cm⁻¹. - **Anzahl Cystein (Cys)** (number): Number of cysteines (counts mode); each disulfide pair contributes 125 M⁻¹cm⁻¹ when oxidized. - **Cystein-Zustand** (select): Reduced cysteines contribute nothing; oxidized pairs (cystines) add 125 each. - **Molekülmasse (kDa, Zählmodus)** (number): Protein molecular weight for the A0.1% conversion in counts mode; 0 skips it. - **Dezimalstellen** (number) ## Wann verwenden - Wenn Sie den theoretischen ε280-Wert eines Proteins aus seiner Sequenz abschätzen möchten. - Wenn nur die Anzahl von Trp-, Tyr- und Cys-Resten sowie gegebenenfalls die Molekülmasse bekannt ist. - Wenn Sie eine A280-Messung mit einem berechneten Extinktionskoeffizienten oder A0.1% einordnen möchten. ## Funktionsweise - Wählen Sie den Sequenzmodus und geben Sie Einbuchstaben-Codes ein; FASTA-Kopfzeilen, Leerzeichen und '*' werden entfernt und W, Y und C gezählt. - Alternativ wählen Sie den Zählmodus und tragen die Anzahlen für Tryptophan, Tyrosin und Cystein ein. - Das Tool berechnet ε280 nach ε280 = 5500×nTrp + 1490×nTyr + 125×nCystin. Reduzierte Cysteine tragen nicht bei; im oxidierten Zustand zählt jedes Cysteinpaar als ein Cystin. - Mit der Molekülmasse wird zusätzlich A0.1% = ε/MW bestimmt. Für eine Konzentrationsabschätzung gilt c = A280/ε. ## Anwendungsfälle - Theoretische A280-Referenzwerte für rekombinante Proteine und Peptide vor einer Messung berechnen. - Den Einfluss von Disulfidbindungen auf den erwarteten Extinktionskoeffizienten vergleichen. - A280-Messwerte mit ε280 oder A0.1% in eine ungefähre Proteinkonzentration umrechnen. ## Häufig gestellte Fragen ### Welche Aminosäuren bestimmen ε280? Berücksichtigt werden Tryptophan, Tyrosin und oxidierte Cysteinpaare, also Cystine. ### Wie werden Cysteine im oxidierten Zustand gezählt? Je zwei Cysteine bilden ein Cystin und tragen 125 M⁻¹cm⁻¹ bei. Ein einzelnes übriges Cystein wird nicht gezählt. ### Was ist der Unterschied zwischen Sequenz- und Zählmodus? Im Sequenzmodus werden W, Y und C automatisch aus der Proteinsequenz gezählt. Im Zählmodus geben Sie die Restanzahlen direkt ein. ### Was bedeutet A0.1%? A0.1% ist die erwartete Absorption einer 1-mg/mL-Lösung und wird als ε/MW berechnet. ### Kann ε280 bei Proteinen ohne Trp und Tyr verwendet werden? Solche Proteine haben nahezu kein ε280. Für die Konzentrationsbestimmung sind dann beispielsweise A205 oder ein BCA-Test geeigneter. ## Ähnliche Tools - [PCR-Annealing-Temperatur-Rechner (Ta = Tm − 5°C)](https://elysiatools.com/de/tools/annealing-temperature-calculator): Berechnet die PCR-Annealing-Temperatur (Ta) nach zwei Regeln: die einfache Laborregel Ta = Tm − 5°C (mit dem KLEINEREN Tm des Primerpaares) und die empirische Formel von Rychlik 1990: Ta = 0.3×Tm(Primer) + 0.7×Tm(Produkt) − 14.9 (Produkt-Tm typisch 75–90°C; die Formel liegt bei typischen Paaren 1–8°C über der einfachen Regel). Liefert die empfohlene Ta, einen ±3°C-Gradientenbereich und die Richtung der Justage: zu niedrige Ta gibt unspezifische Banden und Primerdimere, zu hohe kein Produkt; halten Sie die Primer-Tm-Werte innerhalb von 2–3°C und annealen Sie nach dem kleineren. Quellen: Rychlik 1990, Innis & Gelfand 1990, Lorenz 2012. Nur für die Versuchsplanung. - [Autosomal-dominanter Stammbaum-Analysator](https://elysiatools.com/de/tools/autosomal-dominant-pedigree): Berechnet das Nachkommenrisiko bei autosomal-dominanter (AD) Vererbung und bewertet, wie gut beobachtete Anzahlen zum erwarteten Verhältnis passen. Eltern-Genotypen → erwarteter Anteil: AA × beliebig = alle betroffen; Aa × Aa = 3:1 (75%); Aa × aa = 1:1 (50%); aa × aa = keiner. Beobachtete Anzahlen erlauben einen Chi-Quadrat-Test (df = 1, kritisch 3.841). AD-Stammbaum-Merkmale: vertikale Übertragung, beide Geschlechter gleichermaßen betroffen, Mann-zu-Mann-Übertragung vorhanden (schließt X-gebunden dominant aus), Nicht-Betroffene übertragen nicht (außer de-novo-Mutation). Beispiele: Huntington, Achondroplasie, Marfan. Quellen: Griffiths, Hartl & Clark 2007, StatPearls, OMIM. Nur für Bildungszwecke. - [Autosomal-rezessives Risiko-Rechner](https://elysiatools.com/de/tools/autosomal-recessive-risk): Berechnet die Wahrscheinlichkeit, dass ein Kind (oder mindestens eines von n Kindern) an einer autosomal-rezessiven Krankheit erkrankt. Ein betroffenes Kind (aa) muss von BEIDEN Elternteilen ein rezessives Allel erhalten: P(betroffenes Kind) = P(Elter 1 überträgt a) × P(Elter 2 überträgt a). Status: Überträger (Aa), betroffen (aa), kein Überträger (AA), unbekannt (P(Aa)=c, P(aa)=c² aus Populationsfrequenz). Zwei Überträger → 25% pro Kind, 50% Überträger, P(Überträger | nicht betroffen) = 2/3; mindestens eines von n = 1 − (1−r)^n. Standard 0.04 (Mukoviszidose 1/25). Quellen: Griffiths, Hartl & Clark 2007, StatPearls. Nur für Bildungszwecke, kein Ersatz für genetische Beratung. - [Zellzähl-Rechner für die Neubauer-Kammer](https://elysiatools.com/de/tools/cell-counting-hemocytometer): Rechnet Rohzählungen der verbesserten Neubauer-Kammer in die Konzentration um: Zellen/mL = (Gesamtzahl ÷ Quadrate) × Verdünnung × 10⁴ (jedes 1-mm²-Quadrat bei 0,1 mm Tiefe fasst exakt 0,1 µL). Geben Sie die Gesamtzahl, die Quadratzahl (meist 4 Eck- oder 5 mit Mittelfeld) und die Verdünnung ein; optional das Volumen für die Gesamtzellzahl. Empfehlungen zur Idealdichte von 20–100 Zellen pro Quadrat. Quellen: Freshney-Handbuch, Neubauer-Geometrie. Nur für Ausbildung. - [Zellverdopplungszeit-Rechner](https://elysiatools.com/de/tools/cell-doubling-time): Berechnet die exponentielle Wachstumskinetik aus zwei Zählungen: Verdopplungszeit t_d = ln2 × t ÷ ln(Nₜ/N₀), Zahl der Verdopplungen n = ln(Nₜ/N₀) ÷ ln2 und spezifische Rate μ = ln(Nₜ/N₀)/t (h⁻¹). N₀ und Nₜ sind Zellzahlen oder Dichten in beliebiger konsistenter Einheit; Zeit in Stunden/Tagen/Minuten. Setzt Log-Phase an beiden Punkten voraus (subkonfluente Aussaat, Ernte vor Kontaktinhibition), sonst fällt t_d zu hoch aus; mit Referenzwerten für HEK293/HeLa/CHO. Quelle: Freshney-Handbuch. Nur für Ausbildung. - [Trypanblau-Zellviabilitäts-Rechner](https://elysiatools.com/de/tools/cell-viability-trypan-blue): Berechnet die Viabilität aus den Lebend-/Totzählungen des Trypanblau-Ausschlusstests: Viabilität % = lebende ÷ (lebende + tote) × 100; Lebendkonzentration = Zählung × Verdünnung × 10⁴ ÷ Quadrate. Der Farbstoff passiert intakte Membranen nicht: Lebende Zellen bleiben hell, geschädigte färben sich tiefblau. Enthält eine Kultureinschätzung (≥90% gesund, 70–90% akzeptabel, <70% gestresst) und Protokollhinweise (innerhalb von 3–5 Min zählen; lange Exposition tötet vitale Zellen). Quellen: Freshney, Strober-Protokoll. Nur für Ausbildung. - [KBE/mL-Rechner (koloniebildende Einheiten)](https://elysiatools.com/de/tools/cfu-calculator): Rechnet die Koloniezählung in die Konzentration der Ausgangskultur um: KBE/mL = Kolonien × 10ⁿ ÷ ausplattiertes Volumen (mL), wobei die Platte aus dem 10⁻ⁿ-Röhrchen beimpft wurde. Enthält die zählbare Bereichsregel 30–300 Kolonien pro Platte: >300 meldet TNTC (zu zahlreich, höhere Verdünnung), <30 meldet TFTC (zu wenig, geringere Verdünnung) und 0 Kolonien ergibt die Nachweisgrenze; optionale Umrechnung in Gesamt-KBE. Quellen: Standard Methods, FDA BAM. Nur für Ausbildung. - [DNA-Kopienzahl-Rechner (Konzentration → Kopien)](https://elysiatools.com/de/tools/dna-copy-number-calculator): Rechnet eine DNA-Massenkonzentration in Molekülkopien pro Mikroliter um: Kopien/µL = c(g/µL) × N_A ÷ (Länge bp × 660 g/mol). Unterstützt ng/µL (übliche NanoDrop-Ausgabe, identisch mit µg/mL), pg/µL (Qubit-Bereich) und µg/µL; inklusive pmol/µL-Umrechnung und Gesamt Kopien in einem optionalen Volumen. Richtwert: ein 5.000-bp-Plasmid bei 50 ng/µL → 9.12×10⁹ Kopien/µL (0.0152 pmol/µL). Hinweise: 660 Da/bp ist ein Durchschnitt, der für Plasmide/Genom/Amplicons genügt (bei exakten Oligos Basenmassen summieren); A260 überschätzt bei RNA/freien Nukleotiden — für Genauigkeit Fluoreszenz-Assay nutzen. Quellen: N_A SI 2019, Thermo-Fisher-Konvention, Sambrook & Russell. Nur für die Planung. ## Beispiele - [Web Python Bildverarbeitung Beispiele](https://elysiatools.com/de/samples/web-image-processing-python): Web Python Bildverarbeitungsbeispiele mit PIL/Pillow einschließlich Lesen, Speichern, Skalieren und Formatkonvertierung - [Android Java Bildverarbeitungsbeispiele](https://elysiatools.com/de/samples/android-image-processing-java): Android Java Bildverarbeitungsbeispiele einschließlich Lesen/Schreiben, Skalierung und Formatkonvertierung - [Android Kotlin Bildverarbeitungsbeispiele](https://elysiatools.com/de/samples/android-image-processing-kotlin): Android Kotlin Bildverarbeitungsbeispiele einschließlich Lesen/Schreiben, Skalierung und Formatkonvertierung - [Web Rust Bildverarbeitungsbeispiele](https://elysiatools.com/de/samples/web-image-processing-rust): Web Rust Bildverarbeitungsbeispiele einschließlich Lesen/Schreiben, Skalierung und Formatkonvertierung ## Verwandte Inhalte - [Werkzeuge für Proteinquantifizierung, Enzymkinetik und Sequenzanalyse](https://elysiatools.com/de/hubs/protein-quantification-enzyme-kinetics-sequence-tools): Planen Sie Proteinassays, rechnen Sie Konzentrationen um und analysieren Sie Sequenzen, Aktivität, Kinetik, Hemmung und Bindung in einem Laborworkflow. - [Tools fur Audio-Encoding und Formatkonvertierung](https://elysiatools.com/de/hubs/audio-convert): Vergleiche Audioformat-Konvertierung, Bitratenanderungen, Abtastraten-Konvertierung, Codec-Wechsel und Export-Tools in einem Hub. - [Tools fur Bildformat-Konvertierung und animierten Export](https://elysiatools.com/de/hubs/image-convert): Vergleiche Bildkonverter fur JPG, PNG, GIF, AVIF, WebP, TIFF, ICO, base64 und animationsgeeignete Exporte in einem Hub. - [Tools fur JSON-Austausch und Format-Ubersetzung](https://elysiatools.com/de/hubs/json-convert): Vergleiche JSON-Konvertierungswerkzeuge fur CSV, YAML, TOML, GraphQL, XML, Markdown, Excel, BSON, EDN und ahnliche strukturierte Formate in einem Hub.