# Ligations-Molverhältnisrechner (Insert:Vektor)

Richtet Ligationen nach NEB ein: pmol = ng × 10³ ÷ (650 × bp). Der Massenmodus nutzt die klassische Formel Insert_ng = Verhältnis × Vektor_ng × (Insert_bp ÷ Vektor_bp) (der Faktor 650 kürzt sich); der Prüfmodus nimmt beide Massen und liefert das tatsächliche Molverhältnis. Empfohlene Bereiche nach Insertgröße: <200 bp 5–10:1, 200–999 bp 3–5:1, ≥1000 bp 1–5:1, mit dem Hinweis, dass Verhältnisse >10:1 vor allem Insert-Konkatemere fördern. Mit Reaktionsvolumen folgen nM-Konzentrationen (Ligase ist empfindlich gegenüber Endkonzentration, >1 nM ist effizienter). Quellen: NEB NEBioCalculator und Ligationsleitfaden, Promega BioMath, Sambrook & Russell. Nur für Ausbildung.

> Kanonische Seite: https://elysiatools.com/de/tools/ligation-molar-ratio

- **Kategorie:** Education

- **Schlagwörter:** ligations-molverhältnis, insert-vektor-rechner, ligationsrechner neb, dna-ligation ansatz, insertmasse ng ligation, molarität vektor insert, pmol dna ligation, t4-ligase verhältnis, klonierungs-insert-rechner, dephosphorylierter vektor ligation, molekularbiologie, labor-rechner

## Überblick

Der Ligations-Molverhältnisrechner bestimmt die benötigte Insertmasse für ein gewünschtes Insert:Vektor-Verhältnis oder prüft das tatsächliche Verhältnis aus zwei DNA-Massen. Zusätzlich berechnet er bei Angabe des Reaktionsvolumens die pmol- und nM-Werte und ordnet das Ergebnis anhand der Insertgröße ein.

## Eingaben

- **Berechnungsmodus** (select): Solve for the insert mass a desired ratio needs, or check the actual ratio of two masses.
- **Vektorgröße (bp)** (number): Double-digested vector backbone length in base pairs.
- **Vektormasse (ng)** (number): Mass of the linearized vector in the reaction.
- **Insertgröße (bp)** (number): Insert fragment length in base pairs.
- **Insertmasse (ng)** (number): Insert mass (check mode); ignored in solve mode, which computes the required value.
- **Gewünschtes Insert:Vektor-Verhältnis** (number): Molar insert:vector ratio (solve mode), e.g. 3 for a 3:1 setup.
- **Reaktionsvolumen (µL, optional)** (number): Total ligation volume in µL; enter 0 to skip nM concentrations.
- **Dezimalstellen** (number)

## Wann verwenden

- Wenn du die passende Insertmasse für ein definiertes molares Verhältnis zur Vektormasse berechnen möchtest.
- Wenn du vor einer Ligation prüfen willst, welchem tatsächlichen Insert:Vektor-Verhältnis zwei DNA-Massen entsprechen.
- Wenn du bei bekanntem Reaktionsvolumen die DNA-Mengen zusätzlich als pmol und nM bewerten möchtest.

## Funktionsweise

- Wähle zwischen „Insertmasse berechnen“ und „Tatsächliches Verhältnis prüfen“.
- Gib Vektorgröße, Vektormasse und Insertgröße ein; im Prüfmodus ergänzt du die Insertmasse, im Berechnungsmodus das gewünschte Verhältnis.
- Die Insertmasse wird mit Insert_ng = Verhältnis × Vektor_ng × (Insert_bp ÷ Vektor_bp) berechnet oder das reale Molverhältnis aus beiden Massen bestimmt.
- Optional berechnet der Rechner bei einem Reaktionsvolumen die pmol- und nM-Konzentrationen und vergleicht das Verhältnis mit dem empfohlenen Bereich.

## Anwendungsfälle

- Klonierungsansätze mit definiertem Insert:Vektor-Molverhältnis planen.
- Vorhandene DNA-Mengen auf ein geeignetes Verhältnis für die Ligation prüfen.
- pmol- und nM-Werte eines geplanten Ansatzes für die Reaktionsplanung berechnen.

## Häufig gestellte Fragen

### Welche Eingaben benötigt der Rechner?

Er benötigt Vektorgröße, Vektormasse und Insertgröße. Je nach Modus kommen gewünschtes Verhältnis oder Insertmasse hinzu.

### Wann wird die Insertmasse berechnet?

Im Modus „Insertmasse berechnen (Zielverhältnis)“ aus Verhältnis, Vektormasse sowie Insert- und Vektorgröße.

### Wann sollte ich den Prüfmodus verwenden?

Verwende ihn, wenn beide DNA-Massen bereits feststehen und du das tatsächliche Insert:Vektor-Molverhältnis bestimmen möchtest.

### Welche Verhältnisbereiche werden empfohlen?

Für Inserts unter 200 bp gelten 5–10:1, für 200–999 bp 3–5:1 und ab 1000 bp 1–5:1 als empfohlene Bereiche.

### Was bewirkt die Eingabe des Reaktionsvolumens?

Bei einem Reaktionsvolumen größer als 0 berechnet der Rechner zusätzlich die Konzentrationen von Vektor und Insert in nM.

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